помощью
молекулярного зонда
Обнаружить белок с помощью АТ
Выделить тотальную мРНК,
получить кДНК ис помощью зонда найти кДНК данного гена
- Главная
- Разное
- Бизнес и предпринимательство
- Образование
- Развлечения
- Государство
- Спорт
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Религиоведение
- Черчение
- Физкультура
- ИЗО
- Психология
- Социология
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Что такое findslide.org?
FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.
Обратная связь
Email: Нажмите что бы посмотреть
Презентация на тему Трансгенная мышь с геном гормона роста
Содержание
- 2. Как определить экспрессию генаНайти мРНК данного гена
- 3. Регуляция экспрессии генов на разных уровнях
- 4. 1 уровень регуляции активности геновЭто формирование активно
- 5. Роль модификации и ремоделирования нуклеосом в регуляции
- 6. Модификация гистоновВ регуляции активности генов
- 7. Нуклеосома – это октамер гистонов и 1,7
- 8. Ремоделирование нуклеосом – это изменение их связывания
- 9. Ковалентная модификация включает –Ацетилирование – деацетилированиеФосфорилирование –
- 10. Гистоновый код- Аминокислотный остаток – разные АМК
- 11. Регуляция изменением количества генов и структуры ДНКУтрата
- 12. Активный хроматин – эухроматинНуклеосомная упаковка изменена или
- 13. Метилирование ДНКОткрыто еще до открытия Уотсона и
- 14. Загадки-Отсутствует у дрозофилы и др.Обеспечивает накопление мутаций
- 15. У Dr дрожжейи C.elegans метилирования нет. Нарушение
- 16. Неактивный хроматин – гетерохроматинКонститутивный - центромера, теломера, интеркалярныйФакультативный - при гаметогенезе в Х-хромосомегетерохроматин превращается в эухроматин
- 17. Транспозоны имеют рег элементыТранспозоны ограничены инвертированными повторами.
- 18. Величина генома может бстро увеличиваться за счет
- 19. Регуляция на уровне репликации –В ядрышках ооцитов
- 20. Регуляция генной активности на уровне транскрипцииРегуляция транскрипции
- 21. Структура факторов транскрипцииДНК-связывающий доменДомены активации транскрипцииАнтирепрессорные доменыДомены,
- 22. Типы факторов транскрипции
- 23. Факторы транскрипции – главные регуляторы генной активности
- 24. Транскрипция с разных промоторовВ гене коллагена 43
- 25. Регуляция экспрессии генов у прокариот –на примере лактозного оперона
- 26. В lac-опероне оператор перекрывает промотор и 5-конец 1 структурного гена
- 27. Метаболизм лактозы
- 28. При отсутствии в среде лактозы белок-репрессор связывается
- 29. При появлении лактозы репрессор связывается с ней, а не с оператором, транскрипция идет
- 32. Инсулятор блокирует действие энхансера, если инсулятор находится между энхансером и промотором
- 36. Активациятранскрипцииза счет связываниясap и сAMP
- 37. Регуляция транскрипции транспозонами (Т)Поскольку Т несут в
- 38. Т может изменить границы петель. Некоторые Т
- 39. Эукариотические мРНК довольно стабильны (часы и сутки)До
- 40. Посттранскрипционный уровень регуляции генной активностиТранспорт мРНК из
- 41. Альтернативный сплайсинг как регулятор активности генов
- 42. Редактирование РНК – термин предложенР. Бенни для
- 43. Биологические последствия редактирования РНКОбразование пригодной для трансляции
- 44. Регуляция генной активности на уровне трансляцииИнициация трансляции
- 45. Регуляция синтеза ферритина если железа в среде
- 46. Дискриминация мРНК- инициирующие участки РНК имеют разное
- 47. Трансляционная репрессия – белок репрессор связывается с
- 48. Маскирование мРНК – осуществляется белком связывающимся с
- 49. Рнк не выходит из ядра, пока не
- 50. Посттрансляционный уровень регуляцииФолдинг белкаРоль гликозилирования, фосфорилирование, ацетилирование
- 51. Механизмы сайленсингаГипотеза гистонового кода – ковалентные модификации
- 52. Скачать презентацию
- 53. Похожие презентации
Как определить экспрессию генаНайти мРНК данного гена с помощью молекулярного зондаОбнаружить белок с помощью АТВыделить тотальную мРНК, получить кДНК ис помощью зонда найти кДНК данного гена
Слайд 2
Как определить экспрессию гена
Найти мРНК данного гена с
помощью
получить кДНК ис помощью зонда найти кДНК данного гена
Слайд 4
1 уровень регуляции активности генов
Это формирование активно транскрибируемого
эухроматина и молчащего, компактизованного
гетерохроматина
Гетерохроматин подразделяется на
конститутивный
и факультативныйКонститутивный – в цетромерах, теломерах,
интеркалярный. Наполнен повторяющимися
последовательностями и мобильными элементами
Метилирование лизина по положению 9
в гистоне Н3 – подавление транскрипции
Слайд 5
Роль модификации и ремоделирования нуклеосом
в регуляции генетических
процессов
Нуклеосома – октамер гистонов с намотанной
ДНК в 146
п.н.Имеет кор и хвосты гистоновМодификация нуклеосом включает –
Ремоделирование
Ковалентная модификация гистонов
Замена гистонов
Слайд 7
Нуклеосома – это октамер гистонов и 1,7 витка
суперспирали фрагмента ДНК длиной 146 пар оснований
В целом нуклеосомная
упаковка ограничиваетузнавание последовательности ДНК факторами
транскрипции, репликации и рекомбинации
По отдельным генам нуклеосомы распределяются
неслучайным образом - позиционирование
Позиционирование нуклеосом на промоторе может
быть фактором регуляции транскрипции, как +, так и -
Слайд 8
Ремоделирование нуклеосом – это изменение
их связывания с
ДНК. Осуществляют белки
Перемещение нуклеосом
Изменение расстояния между нуклеосомами
Удаление гистонов
Сборка гистонов
Слайд 9
Ковалентная модификация включает –
Ацетилирование – деацетилирование
Фосфорилирование – дефосфорилирование
Метилирование
убиквитирование
Метилирование лизина по положению 9
в гистоне Н3 –
подавление транскрипции, частоэто сочетается с метилированием ДНК по цитозину
Ацетилирование лизина по положению 9
в гистоне Н3 в сочетании с метилированием
лизина в положении 4– подавление транскрипции
Слайд 10
Гистоновый код-
Аминокислотный остаток – разные АМК могут
Подвергаться модификации – Лиз, Арг, Сер, Тре
2. Модифицирующие ферменты
– их много 3. Белки, воспринимающие модификацию гистонов
Комбинация всех этих факторов – и есть гистоновый код
Обеспечивают активацию и сайленсинг генов, очевидно
помогая факторам транскрипции
Слайд 11
Регуляция изменением количества генов и структуры
ДНК
Утрата генетического
материала –диминуция
хроматина, разрушение ядра у эритроцитов
Амплификация генов –
Р-гликопротеина, рРНКРеаранжировка генных сегментов
А) в генах И
Б) у сальмонеллы инверсия промотора обусловливает разные типы флагеллина и обеспечивает ускользание от И.О.
∙ Роль транспозонов в регуляции активности генов.
∙ Эу- и гетерохроматин. Двойная спираль может принимать разные формы
∙ Инактивация Х-хромосомы
∙ Роль метилирования ДНК в регуляции экспрессии генов
Слайд 12
Активный хроматин – эухроматин
Нуклеосомная упаковка изменена или отсутствует
Длинные
участки, чувствительные к ДНК-азе 1,
указывающие на возможность транскрипции
Гиперчувствительные
сайты к ДНК-азе 1, ассоциированные с энхансерными элементами у
начала гена
Более слабая упаковка ДНК под электронным
микроскопом
В политенных хромосомах – это пуфы
Слайд 13
Метилирование ДНК
Открыто еще до открытия Уотсона и Крика,
но до сих пор остается много интригующих загадок
Метилируется цитозин
в 5 положении и аденин в 6 положенииРегуляция транскрипции
Клеточная дифференцировка и эмбриональное развитие
Геномный импринтинг
Инактивация мобильных элементов
Канцерогенез
Генетические заболевания человека
Замалчивание генов
Слайд 15 У Dr дрожжейи C.elegans метилирования нет. Нарушение метилирования
у человека приводит к остановке эмбрионального развития. Метилирование запрещено
в сайтах старта транскрипции почти половины генов человека.метилирование связано с гетерохроматином
При раке метилирование понижено, что приводит к геномной нестабильности, может и наоборот – повышение метилирования генов –супрессоров
Метилтрансфераза в соответствии с матрицей метилирует сайт на дочерней нити ДНК. Как узнает ???
Слайд 16
Неактивный хроматин – гетерохроматин
Конститутивный - центромера, теломера, интеркалярный
Факультативный
- при гаметогенезе в Х-хромосоме
гетерохроматин превращается в эухроматин
Слайд 17
Транспозоны имеют рег элементы
Транспозоны ограничены инвертированными повторами. При
вырезании Т они сближаются и точно отрезаются от основной
ДНК. Затем транспозаза делает разрез в новом месте, куда внедряется Т по типу «вырезание-встраивание»Ретротранспозоны – ограничены длинными концевыми повторамираспространяются с пом обр транскрипции с использованием закодированной в них интегразы
Нарушают работу гена
Вызывают мутации
Меняют регуляцию гена
Слайд 18 Величина генома может бстро увеличиваться за счет распространения
транспозонов
4 хр-ма Др. буквально набита Т
У-хр-ма человека, Х хр-ма,
21 и 22 содержат много ТСайт-специфические ретроТ- это те, которые внедряются только в определенном месте. Например Het.Nart, у Др отвечают за целостность теломер
Р-элемент Др внедряется в 5’ регулир область БТШ 70
Т могут одомашниваться, т.е. выполнять функцию промотора, инсулятора и т.д.
Слайд 19
Регуляция на уровне репликации –
В ядрышках ооцитов образуются
экстрахромосомные копии генов рРНК. Этим достигается усиление синтеза рибосом
Слайд 20
Регуляция генной активности на уровне транскрипции
Регуляция транскрипции у
прокариот( лактозный оперон)
Позиционирование нуклеосом
Регуляция транскрипции гормонами- один гормон, например
ГК, может регулировать несколько ГК зависимых генов. ГК связывается с R – это и есть фактор транскрипцииТранскрипция с разных промоторов (альтернативные промоторы)
Базальный транскрипционный комплекс
Факторы транскрипции.
Локусконтролирующие районы
РНК-интерференция
Транскприпционная синергия
Рибопереключатели – аптамеры, например соединенные с глицином. Когда его много, они включают гены для использования его как источник энергии
Слайд 21
Структура факторов транскрипции
ДНК-связывающий домен
Домены активации транскрипции
Антирепрессорные домены
Домены, связывающие
лиганды
Лиганды-индукторы –гормоны, ретиноевая кислота, гормон щитовидной железы и лиганды
–репрессоры-конечные продукты метаболических путей
Слайд 24
Транскрипция с разных промоторов
В гене коллагена 43 экзона
и 2 промотора варианты транскрипции приводят к образованию 3
изоформ белка – 1 короткой и 2 длинных. Дисбаланс изоформ приводит к патологии сетчатки глазаФрагмент С-концевого участка коллагена – эндостатин содержит 2 дисульфидные связи ( 183 АМК)
Рецептор пролактина имеет 3 промотора, обладающих разн тканеспецифичностью
Слайд 28
При отсутствии в среде лактозы белок-репрессор
связывается с
оператором и препятствует соединению
РНК-полимеразы с промотором и отменяет
транскрипцию
3-х генов.
Слайд 32
Инсулятор блокирует действие энхансера, если инсулятор
находится между
энхансером и промотором
Слайд 37
Регуляция транскрипции транспозонами (Т)
Поскольку Т несут в своем
составе регуляторные сигналы для Тр, (промоторы, энхансеры, сайленсеры, инсуляторы)то
перемещение этих сигналов по хромосоме может изменять Тр смежных с ними геновПосле удаления Т его промотор может остаться на месте
ретроТ внедряются чаще в регуляторные районы генов. При этом ген-хозяин не портится и терпит Т
Брешь после удаления Т может залечиваться с ошибками, т. е. остается след после Т в виде мутации
Слайд 38 Т может изменить границы петель. Некоторые Т могут
нести последовательности инсулятора, с которым связываются белки. Например, у
gypsy последовательность инсулятора повторена 12 разТ могут участвовать в перестройках хромосом. Например, mariner обеспечивает неравный кроссинговер и делецию в 17 хромосоме, что проявляется в нейродегенеративных заболеваниях и повышении уровня холестерина
Слайд 39 Эукариотические мРНК довольно стабильны (часы и сутки)До выхода
в цитоплазму они проходят процессинг. Поэтому часто регуляция на
уровне транскрипции не возможна. Возрастает важность следующего уровня
Слайд 40
Посттранскрипционный уровень регуляции генной
активности
Транспорт мРНК из ядра
Процессинг
мРНК
Альтернативный сплайсинг
Редактирование мРНК ( Аро-В в печени 4563 АМК,
в кишечнике – В-48- 2152 АМК, за счет изменения в 2153 САА на UAA т.е. образование стоп-кодона
Альтернативные сайты полиаденилирования обеспечивают разную силу матрицы
Слайд 42
Редактирование РНК – термин предложен
Р. Бенни для феномена
встраивания 4 У .
В митохондриальный транскрипт
одной из
субъединиц цитохромоксидазытрипаносомы brucei. Это исправляет
закодированный в ДНК сдвиг рамки
Считывания и приводит к синтезу функц. белка
Процесс осущ-ся гидовой РНК. Редактируемый комплекс наз. Эдитосома
У млекопит. обнаружено тканеспец. Редактирование мРНК аполипопротеина В путем
дезаминирования С –U и модификацию А-Т в гене рецептора глутамата
Слайд 43
Биологические последствия редактирования РНК
Образование пригодной для трансляции РНК
И
редактированная и нередактированная РНК могут быть матрицами для трансляции
белков, различающихся по функцииПозволяет синтезировать 2 тРНк с одного гена ( в митохондриях животных)
Может сделать мРНК более стабильной
Т.О. – это механизм регуляции генной активности
Слайд 44
Регуляция генной активности на уровне трансляции
Инициация трансляции с
альтернативных сайтов
Регуляция активности матрицы. Очень активные мРНК у вирусов
и фагов, у мажорных белковРегуляция полужизни матрицы ( ген глобина 10 часов.
гены факторов роста менее 1 часа, гены гистонов в S-периоде – несколько часов, в G2 –периоде – 10-15 минут)
Изменение стабильности мРНК
Роль 5 и 3 НТО в регуляции трансляции ( регуляция синтеза ферритина)
Изменение скорости трансляции
Альтернативные сайты терминации трансляции
Зависимость от контекста. Так, селеноцистеин кодируется стоп-кодоном UGA если за ним определенный контекст. Контекст называют вторым генетическим кодом
Слайд 45 Регуляция синтеза ферритина если железа в среде мало,
то соответствующая мРНК не транслируется.Ингибирование происходит на стадии инициации
белком, который имеет сродство к ионам железа и связываясь с ним отваливается от ферритиновой мРНК. Вновь синтезированный ферритин отнимает железо от репрессора, который опять приобретает сродство к ферритиновой мРНК и останавливает синтез ферритина. Сюрприз в том, что репрессор – это известный фермент цикла Кребса- аконитазаСлайд 46 Дискриминация мРНК- инициирующие участки РНК имеют разное сродство
к рибосомам и поэтому с разной эффективностью связывают их.
Поэтому существуют сильные и слабые матрицы. Это определяется факторами инициации, которые локализуются на инициирующих субъединицах рибосом, зависит от контекста в районе AUG, шпилек и удлинения 5’НТО, декепирования мРНКНормальная трансляция зависит от положения мРНК в клетке. Так, в ооцитах Dr мРНК генов oskar и nanos для трансляции должна занять место на переднем конце яйца, а для гена bicoid –на заднем. Это обеспечивается связыванием с тубулином и актиновыми филаментами
Слайд 47 Трансляционная репрессия – белок репрессор связывается с участком
инициации трансляции и препятствует связыванию инициирующей рибосомы. Часто репрессором
служит продукт данной РНК (ферритин)Слайд 48 Маскирование мРНК – осуществляется белком связывающимся с 3’
НТО. Как связывание с хвостом затыкает рот всей мРНК?
Очевидно за счет изменения конформации молекулы. Макирование и демаскирование мРНК – это прием быстрого регулирования синтеза РНК у эукариотСлайд 49 Рнк не выходит из ядра, пока не закончится
ее процессинг.
У ВИЧ есть регулируемый ядерный транспорт. Он заключается
в том, что после транскрипции его РНК, клеточный механизм не может их выпустить из ядра, но у вируса на этот случай имеется ген Rev, облегчающий выход непроцессированных вирусных РНк в цитоплазму для дальнейшей трансляции6. Белки, связываясь с 3’НТО и 5’НТО подавляют трансляцию
7. Фосфорилирование инициирующих факторов регулирует синтез белка
7. Подавление трансляции ми РНК
Слайд 50
Посттрансляционный уровень регуляции
Фолдинг белка
Роль гликозилирования, фосфорилирование,
ацетилирование и
др и др. модификации белка
Удаление частей полипептида (интеинов, сигнальной
последовательности)Феномен прионизации белка
Слайд 51
Механизмы сайленсинга
Гипотеза гистонового кода – ковалентные модификации ДНК
и гистонов
гипоацетилирование, убиквитирование и фосфорилирование гистонов
Метилирование гистонов
и ДНК В результате образуются участки компактизации хроматина,не способные к транскрипции
На цитологическом уровне сайленсеры – это участки
гетерохроматина
