был пострижен в монашество с именем Митрофан в Золотниковской
пустыни в честь Успения Божией Матери. Митрофан был известен строгой монашеской жизнью, и уже в 1665 году по просьбе братии был поставлен игуменом обители. Во время его настоятельства в монастыре был построен новый Спасский храм, который был снабжён всей необходимой церковной утварью[1].С 1675 года Митрофан являлся игуменом монастыря, которому покровительствовал царствующий дом Романовых.
В 1677 по поручению Патриарха Иоакима игумен Митрофан обследовал церкви и заменял в храмах старопечатные богослужебные книги на новые. В 1680 году, одновременно с настоятельством в монастыре, он был назначен десятильником — управляющим десятиной, в состав которой входили 94 храма.