Презентация на тему Геномика. Протеомика. Значение для поиска новых лекарств

поиска новых ЛП.
1
Виды геномики.
2
Протеомика. Определение. Цели и задачи. Значение

для поиска новых ЛП.

3

2

отцовский и материнский. Или совокупность генов, содержащихся в одинарном

или гаплоидном наборе хромосом и в нехромосомных генах организма.

3

и роли, которые играют различные гены, индивидуально и в

комплексе, в определении структуры, направлении роста, развития и регуляции биологических функций.

4

количества генов, их последовательности;
1.2 количества нуклеотидов в каждом гене

и их последовательности;
1.3 определение функций каждого гена по отношению метаболизма к организму.

5

2.2 видовые (индивидуальные) отличия от других организмов;
2.3 предвидеть реакцию

на внешние воздействия, зная последовательность нуклеотидов в каждом из генов и число генов.

6

свойствах клетки (напр.: «молчащие гены»).
7

гены патогенных микроорганизмов получили название ivi генов (генов вирулентности),

несмотря на то, что в их число входят не только гены, кодирующие образование токсинов, адгезинов и других факторов вирулентности. К ним относят также гены ферментов и транспортных белков, позволяющих патогенной микробной клетке жить и размножаться в тканях макроорганизма в условиях дефицита некоторых органических веществ и неорганических ионов.

ионов железа, чего не бывает на обычных питательных средах.

В этом случае в клетке синтезируется специальная система транспорта железа в клетку из среды с малой его концентрацией; фактически транспорт идет против градиента концентрации. Для образования такой системы необходима экспрессия определенных генов. Из молчащих («несущественных») они становятся «существенными», то есть подавление их функций отобранными ингибиторами приведет к подавлению роста (размножения) патогена именно в условиях in vivo, т.е. в инфицированном организме. Это, собственно, и есть цель исследователей, создающих новые лекарственные препараты.

клетке патогена экспрессируются только ivi гены. Большинство генов экспрессируется

и in vivo и in vitro. Их продукты необходимы клетке всегда. Такие гены получили образное название "house keeping gens", что означает, "гены, на которых держится дом". Эти гены экспрессируются в любых условиях, поскольку без них клетка просто не может существовать.
Соотношение между house keeping gens и ivi gens у разных патогенных бактерий варьирует, но более 90% генов принадлежит к первой группе.
Поскольку ингибиторы house keeping gens обнаруживаются при поиске на питательных средах in vitro, практически все применяемые в клинике антибиотики и синтетические антибактериальные препараты являются ингибиторами функций именно этих генов.
Гены, кодирующие эти защитные ферменты не относятся к house keeping gens. При этом, ингибиторы беталактамаз сами почти не обладают антибактериальной активностью и применяются вместе с беталактамными антибиотиками. Последние, в свою очередь, ингибируют активность транспептидазы пептидогликана, гена принадлежащего к house keeping gens.
Таким образом, ivi гены (их продукты) составляют набор таргетов для использования их только в будущем.

на питательных средах in vitro, практически все применяемые в

клинике антибиотики и синтетические антибактериальные препараты являются ингибиторами функций именно этих генов.
Гены, кодирующие эти защитные ферменты не относятся к house keeping gens. При этом, ингибиторы беталактамаз сами почти не обладают антибактериальной активностью и применяются вместе с беталактамными антибиотиками. Последние, в свою очередь, ингибируют активность транспептидазы пептидогликана, гена принадлежащего к house keeping gens.
Таким образом, ivi гены (их продукты) составляют набор таргетов для использования их только в будущем.

полной последовательности нуклеотидных пар в гене, хромосоме (хромосомах).
1.1. Идентификацию

генов осуществляют с помощью специальных компьютерных программ.

8

по последовательности нуклеотидов в генах, полученных из разных источников.

9

каждым отдельным геном, и роли этого белка в метаболизме.
10

связанные с ними данные, включая последовательности ДНК и РНК.

Вычислительная геномика является разделом биоинформатики.

12

помощью математических, статистических и компьютерных методов.
13

является построение генетической и физической карт генома человека и

определение полной нуклеотидной последовательности ДНК

14

прокариота или эукариота.
18

– геном) – наука, основным предметом изучения которой является

белки и их взаимодействия в живых организмах, в том числе – в человеческом.

19

экспериментального сопоставления их качественного и количественного состава в клетке;
Установление

взаимосвязи между структурой белка и его функциями.

21

с последующим анализом методами биоинформатики.
22

одного, а сразу множества белков, включает специальный цикл операций

определения.

24

и очистка белков с помощью двумерного электрофореза.

2. Разделение проводят

по двум направлениям:
- молекулы белка разной массы,
- молекулы, имеющие различный суммарный электрический заряд.

25

пятен (белков) может быть 1000.
Молекулы группируются на специальном

носителе, образуя макроскопические пятна.

26

структуры с помощью масс-спектрометрии.
27

очистке, определению первичной, вторичной и третичной структур всех белков

живого организма, а ее основными средствами являются двумерный электрофорез, масс-спектрометрия и биоинформатика.

30

которой присутствует множество молекул других химических классов – сахаров,

липидов, простагландинов, различных ионов и многих других, включая молекулы воды.

32

белков и пептидов в одном организме.
33

лекарственных средств, методов лечения многих заболеваний, диагностических тестов.
34

БИОИНФОРМАТИКИ