Слайд 2
План: Анализ результатов гель-электрофореза Программное обеспечение для анализа и обработки
изображений Программный комплекс ImageJ
Слайд 3
Анализ результатов гель-электрофореза Можно выделить три основных метода детекции
результатов электрофореза:
При визуальном методе гель просматривают непосредственно в УФ,
субъективно оценивая результат
При фотографическом методе полученный гель фотографируют, проводя дальнейшую диагностику по фотоснимкам
При цифровом методе изображения гелей получают с помощью цифрового фотоаппарата с последующим вводом в компьютер. Метод позволяет получать изображения в реальном времени, использовать цифровую обработку изображений, а также автоматизировать процесс определения количественных показателей (напр., количество и размер ДНК в полосе свечения) и диагностики, осуществлять ведение базы данных
Слайд 4
Чувствительность фотографического и цифрового метода детекции сопоставимы и
составляют 0,1–1 нг ДНК при окрашивании ЭБ Анализ результатов гель-электрофореза
Слайд 5
Пакеты бесплатного программного обеспечения
Слайд 6
Программный комплекс ImageJ
Программа ImageJ представляет собой графический редактор,
позволяющий производить анализ изображений.
Слайд 7
Программный комплекс ImageJ
ImageJ позволяет отображать, редактировать, анализировать, обрабатывать,
сохранять и печатать 8-битные, 16-битные и 32-битные изображения Комплекс может
читать многие форматы изображений, такие как TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS В ImageJ можно вычислять площади, статистические показатели пиксельных значений различных выделенных областей интереса на изображениях, которые выделены вручную. Он может создавать гистограммы плотности и рисовать профили линий. Комплекс позволяет производить различные геометрические преобразования, такие как масштабирование, поворот или отражение
Слайд 8
Основное окно программы ImageJ
Изображение электрофоретической подвижности препаратов ДНК: а)
высокополимерной линейной ДНК, выделенной из молок лосося (IСN); б)
ДНК фага λ, расщепленной эндонуклеазой Hind III на линейные фрагменты с фиксированной длиной; в) плазмидной ДНК pUC19
Слайд 9
Возможности программы
Примеры выделений Гистограмма изображения Гистограмма изображения в табличном