сайты рестрикции и одинаково их расщепляющие.
Метилчувствительные рестриктазы:
HpaII и
MspI (CCGG) – первый не расщепляет ДНК, если хотя бы один из остатков C метилирован; N-метилирование остатков A – Sau3A (и GATC и GMeATC), DpnI (только GMeATC), MboI (только GATC)
Гетерошизомеры
Узнают одинаковые сайты рестрикции, но по-разному их расщепляют (KpnI - G↓GTACC, Asp7181 - GGTAC↓C)
Изокаудомеры
Узнают разные сайты рестрикции, но создают одинаковые липкие концы. Лигирование с потерей сайта рестрикции