Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Основы генной инженерии

Содержание

Изомеры рестриктазИзошизомеры Рестриктазы разных видов бактерий, узнающие одинаковые сайты рестрикции и одинаково их расщепляющие. Метилчувствительные рестриктазы:HpaII и MspI (CCGG) – первый не расщепляет ДНК, если хотя бы один из остатков C метилирован; N-метилирование остатков A –
Основы генной инженерииФерменты (продолжение)ВекторыЛекция 2 Изомеры рестриктазИзошизомеры Рестриктазы разных видов бактерий, узнающие одинаковые сайты рестрикции и одинаково Свойства, которыми должен обладать любой векторСпособность к длительному существованию в клетках-хозяевах (репликация Плазмидные векторы Биологические свойства бактериальных плазмид, используемые в векторахМолекулярные эндосимбионты – автономная 	репликацияНегативный контроль Плазмидный вектор pUC18bla – Ген β-лактамазы, селектируемый маркер (устойчивость ампициллину)ori – Точка Плазмидный вектор BluescriptPromegaФагмида (Phagemid) Расщепление Xgal β-галактозидазойCl Вектор для слияния генов pGEX-P-3Ген глутатион-S-трансферазыИммобилизованный глутатион Регуляция экспрессии генов в векторе pETБактериальнаяклетка BL21DENovagene TA-Клонирование продуктов ПЦРTaq-ДНК-полимераза образует в продукте ПЦР 3’-выступающие A-концы Побочные продукты лигирования вектора и вставкиКольцевые мономерыЛинейные ди-, три-, … мультимерыКольцевые димерыРекомбинантная плазмида Предотвращение образования плазмидного вектора без вставки с помощью щелочной фосфатазы5’Лигирование, трансформация5’5’ Векторы на основе хромосомы фага λ Жизненный цикл фага λДва пути развития бактериофага: Лизогенный: интеграция в хромосому хозяинаЛитический:а) Двухсторонняя θ-репликация;б) Катящееся кольцо Репликация ДНК фага λcos-Сайты ДНК фага λcohesive sites, 12 п.н. Упаковка ДНК фага λ in vitroЛизогенныештаммыE. coliШтамм 1Штамм 2Смесь экстрактов клеток двух Инсерционный вектор лямбда gt10Вставка чужеродной ДНК до 7.6 т.п.о. по EcoRI-сайту Использование вектора лямбда EMBL4 с замещением внутренней области Космидный вектор (космида) с2XB Искусственные хромосомы Искусственная хромосома дрожжей YAC (Yeast Artificial Chromosome)>2000 т.п.н.ura3 – ген оротидин-5’-фосфатдекарбоксилазыжизненноважный: позитивный Бактериальная искусственная хромосома (BAC)CmroriSrepEparAparBparA, parB – контроль числа копий (1-2)Cmr – селектируемый Клонирование ДНК с помощью BAC Получение искусственных хромосом животных методом «сверху-вниз» Евгений Витальевич Ананьев, 1970-еИскусственные хромосомы кукурузыПервооткрыватель мобильных генетических элементов у дрозофилы Внехромосомные (эписомные) векторы для экспрессии рекомбинантных генов в клетках животных Челночный эписомный Емкости векторов разных классов Способы введения ДНК в бактериальные клеткиТрансформация   107- 108 колоний/мкг ДНКканалы,
Слайды презентации

Слайд 2 Изомеры рестриктаз
Изошизомеры
Рестриктазы разных видов бактерий, узнающие одинаковые

Изомеры рестриктазИзошизомеры Рестриктазы разных видов бактерий, узнающие одинаковые сайты рестрикции и

сайты рестрикции и одинаково их расщепляющие.
Метилчувствительные рестриктазы:
HpaII и

MspI (CCGG) – первый не расщепляет ДНК, если хотя бы один из остатков C метилирован;
N-метилирование остатков A – Sau3A (и GATC и GMeATC), DpnI (только GMeATC), MboI (только GATC)
Гетерошизомеры
Узнают одинаковые сайты рестрикции, но по-разному их расщепляют (KpnI - G↓GTACC, Asp7181 - GGTAC↓C)
Изокаудомеры
Узнают разные сайты рестрикции, но создают одинаковые липкие концы. Лигирование с потерей сайта рестрикции




Слайд 3 Свойства, которыми должен обладать любой вектор
Способность к длительному

Свойства, которыми должен обладать любой векторСпособность к длительному существованию в клетках-хозяевах

существованию в клетках-хозяевах (репликация автономная или в составе хромосом)
Наличие

биохимических или генетических маркеров, которые позволяют обнаруживать его присутствие в клетках
Должны допускать встраивание чужеродной ДНК без нарушения своей функциональной целостности

Слайд 4 Плазмидные векторы

Плазмидные векторы

Слайд 5 Биологические свойства бактериальных плазмид, используемые в векторах
Молекулярные эндосимбионты

Биологические свойства бактериальных плазмид, используемые в векторахМолекулярные эндосимбионты – автономная 	репликацияНегативный

– автономная репликация
Негативный контроль числа копий
Низкокопийные (1-2 копии на

клетку)
Высококопийные (10-100 копий на клетку)
Консервативность размера
Минимальный размер определяется элементами внутриклеточной автономии
Ограничения на размер вставки чужеродной ДНК
Совместимость разных плазмид в клетке
Группы несовместимости
Случайная сегрегация в дочерние клетки

Слайд 6 Плазмидный вектор pUC18
bla – Ген β-лактамазы, селектируемый маркер

Плазмидный вектор pUC18bla – Ген β-лактамазы, селектируемый маркер (устойчивость ампициллину)ori –

(устойчивость ампициллину)
ori – Точка начала репликации (origin)
lacZ ‘ –

N-концевая часть гена β-галактозидазы (кодирует146 из 1021 АК- остатков), селектируемый маркер (хромогенный субстрат X-Gal)
lacI – Ген Lac-репрессора (Индуктор – IPTG)

Полилинкер


Слайд 7 Плазмидный вектор Bluescript
Promega
Фагмида (Phagemid)

Плазмидный вектор BluescriptPromegaФагмида (Phagemid)

Слайд 8 Расщепление Xgal β-галактозидазой
Cl

Расщепление Xgal β-галактозидазойCl

Слайд 9 Вектор для слияния генов pGEX-P-3
Ген глутатион-S-трансферазы
Иммобилизованный глутатион

Вектор для слияния генов pGEX-P-3Ген глутатион-S-трансферазыИммобилизованный глутатион

Слайд 10 Регуляция экспрессии генов в векторе pET
Бактериальная
клетка BL21DE
Novagene

Регуляция экспрессии генов в векторе pETБактериальнаяклетка BL21DENovagene

Слайд 11 TA-Клонирование продуктов ПЦР
Taq-ДНК-полимераза образует в продукте ПЦР 3’-выступающие

TA-Клонирование продуктов ПЦРTaq-ДНК-полимераза образует в продукте ПЦР 3’-выступающие A-концы

A-концы


Слайд 12 Побочные продукты лигирования вектора и вставки
Кольцевые мономеры
Линейные ди-,

Побочные продукты лигирования вектора и вставкиКольцевые мономерыЛинейные ди-, три-, … мультимерыКольцевые димерыРекомбинантная плазмида

три-, … мультимеры
Кольцевые димеры
Рекомбинантная плазмида


Слайд 13 Предотвращение образования плазмидного вектора без вставки с помощью

Предотвращение образования плазмидного вектора без вставки с помощью щелочной фосфатазы5’Лигирование, трансформация5’5’

щелочной фосфатазы
5’
Лигирование, трансформация
5’
5’


Слайд 14 Векторы на основе хромосомы фага λ

Векторы на основе хромосомы фага λ

Слайд 15 Жизненный цикл фага λ
Два пути развития бактериофага:

Лизогенный:

Жизненный цикл фага λДва пути развития бактериофага: Лизогенный: интеграция в хромосому хозяинаЛитический:а) Двухсторонняя θ-репликация;б) Катящееся кольцо

интеграция в хромосому хозяина
Литический:
а) Двухсторонняя θ-репликация;
б) Катящееся кольцо


Слайд 16 Репликация ДНК фага λ
cos-Сайты ДНК фага λ
cohesive sites, 12

Репликация ДНК фага λcos-Сайты ДНК фага λcohesive sites, 12 п.н.

п.н.


Слайд 17 Упаковка ДНК фага λ in vitro
Лизогенные
штаммы
E. coli
Штамм 1
Штамм

Упаковка ДНК фага λ in vitroЛизогенныештаммыE. coliШтамм 1Штамм 2Смесь экстрактов клеток

2
Смесь экстрактов клеток двух штаммов содержит все компоненты капсида

фага λ

Жизнеспособный фаг λ


Слайд 18 Инсерционный вектор лямбда gt10
Вставка чужеродной ДНК до 7.6

Инсерционный вектор лямбда gt10Вставка чужеродной ДНК до 7.6 т.п.о. по EcoRI-сайту

т.п.о. по EcoRI-сайту


Слайд 19 Использование вектора лямбда EMBL4 с замещением внутренней области

Использование вектора лямбда EMBL4 с замещением внутренней области

Слайд 20 Космидный вектор (космида) с2XB

Космидный вектор (космида) с2XB

Слайд 21 Искусственные хромосомы

Искусственные хромосомы

Слайд 22 Искусственная хромосома дрожжей YAC (Yeast Artificial Chromosome)
>2000 т.п.н.
ura3 –

Искусственная хромосома дрожжей YAC (Yeast Artificial Chromosome)>2000 т.п.н.ura3 – ген оротидин-5’-фосфатдекарбоксилазыжизненноважный:

ген оротидин-
5’-фосфатдекарбоксилазы
жизненноважный:
позитивный отбор
5-фтороротовая кислота (нетоксична)
5-фторурацил (токсичен)
негативный отбор


Слайд 23 Бактериальная искусственная хромосома (BAC)
Cmr
oriS
repE
parA
parB
parA, parB – контроль числа

Бактериальная искусственная хромосома (BAC)CmroriSrepEparAparBparA, parB – контроль числа копий (1-2)Cmr –

копий (1-2)

Cmr – селектируемый маркер

oriS, repE – односторонняя

репликация

cosN – сайт терминазы λ

loxP – cre-рекомбиназа фага P1

cosN

loxP

Емкость – 300 т.п.н.
Стабилен на протяжении 100 генераций


Слайд 24 Клонирование ДНК с помощью BAC

Клонирование ДНК с помощью BAC

Слайд 25 Получение искусственных хромосом животных методом «сверху-вниз»

Получение искусственных хромосом животных методом «сверху-вниз»

Слайд 26 Евгений Витальевич Ананьев, 1970-е
Искусственные хромосомы кукурузы

Первооткрыватель мобильных генетических

Евгений Витальевич Ананьев, 1970-еИскусственные хромосомы кукурузыПервооткрыватель мобильных генетических элементов у дрозофилы

элементов у дрозофилы


Слайд 27 Внехромосомные (эписомные) векторы для экспрессии рекомбинантных генов в

Внехромосомные (эписомные) векторы для экспрессии рекомбинантных генов в клетках животных Челночный

клетках животных
Челночный эписомный вектор на основе вируса Эпштейна-Барр

EBNA1

– Epstein-Barr nuclear
antigen 1
OriP – Область начала репликации в клетках животных
ORI – Область начала репликации в бактериальных клетках
AMP – Ген устойчивости к ампициллину
polyA – сайт полиаденилирования

20-300 копий на клетку. Стабильно распределяются между дочерними клетками.


Слайд 28 Емкости векторов разных классов

Емкости векторов разных классов

  • Имя файла: osnovy-gennoy-inzhenerii.pptx
  • Количество просмотров: 118
  • Количество скачиваний: 0
- Предыдущая УДАЛЕНИЕ ЗУБОВ
Следующая - Цветок. Плод. Семя