1802 г. здесь срубили первую избу крестьяне Пшеничников, Коновалов,
Панов и Коченгин, переехавшие из Тогура. В 1803 году началась постройка церкви, перевезенной из д. Иванкино, а в 1805 году она была освещена.
Назвали деревню Инкино, т.к. она находилась на земле, принадлежащей Инкиным юртам. Селение Инкины юрты возникло значительно раньше: уже в 1710 году в Нарымском уезде отмечают юрты Секенака Инкова.
В археологическую карту Томской области включено несколько памятников, расположенных как в самом селе Инкино, так и в его окрестностях:
Юрты Инкины (Инкинское древнее жилье), относится к позднему средневековью. В 1965 году Людмилой Александровной Чиндиной, археологом, а в будущем профессором ТГУ, здесь собрана керамика ХIVXVIIвв. и бронзовый перстень с печаткой.
История возникновения