Презентация на тему Пространственная структура глобулярных белков

– скелетная модель
4 – ход главной цепи
5 – схема

строения белка
(топология белковой глобулы)

6 – структурный каркас
белка (архитектура упаковки
α- и β-сегментов в глобулу)

Строение белка α-субъединицы интерлейкина 8
(разная степень схематизации)

(«чистые» β-белки, «чистые» α-белки, и «смешанные» α/β и α+β

белки)
относится к малым белкам, а также к отдельным доменам
(т.е. к компактным субглобулам, из которых сложены большие белки).

Скрученность β-листа. β-тяжи изображены стрелками, водородные связи между ними

 —  голубыми линиями.
(б) Схематическое изображение одного витка β-тяжа, вид с торца.
Кружки  —  боковые группы; их номера возрастают по мере удаления.
Голубые линии указывают направление С=О групп, завязывающих Н-связи в листе.
Большая стрелка  —  поворот β-тяжа при приближении к нам на один остаток. Малая стрелка  —  поворот направленных в одну сторону водородных связей при приближении к нам на два остатка.

β-структуре

формы)
Продольная
(угол поворота -30о,
гидрофобное ядро плоское)

в сериновой протеазе
типа химотрипсина
Мотив укладки цепи
в кислой протеазе
типа

пепсина

β-цилиндр

домене γ-кристаллина, в β-домене белка – катаболического активатора (САР)

и в белке оболочки сателлитного вируса некроза табака.

β-сэндвич

æ иммуноглобулина
5 4
Топологическая
схема
Вид «снизу»

β-сэндвич

из β-сэндвичей

параллельной β-структуры,
что встречается редко!

характер β-листов в β-белках тесно
связан с тем, что их

архитектура основана на β-шпильках.

«меандр»

два «греческих ключа»

такие характерные, часто встречающиеся в белках структуры (шпильки, меандр,

греческий ключ, abcd-структуры и т.д.), сложенные из соседних по цепи элементов β (и/или α) структуры, часто называют "супервторичными" структурами.