Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Стукурная организация белка

Содержание

История изученияБелки были выделены в отдельный класс биологических молекулБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII векеБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана ФуркруаБелки
Структурная организация белкаЛекция № 2 История изученияБелки были выделены в отдельный класс биологических молекулБелки были выделены в Мономерами белков являются аминокислотыкарбоксильная группарадикаламиногруппа Олигопептиды содержат до 20 амк (среди них различают ди-, три-, тетра- и Образование пептидной связиСхематическое изображение образования пептидной связи. Подобная реакция происходит в молекулярной Свойства белковРазмер белка может измеряться в числе аминокислот или в дальтонахРазмер белка - Амфотерность - Способность к ионизации в растворе - Характерной константой белков Классификация белковПо химическому строениюпростые;сложные;По выполняемой функциибелки-ферментыбелки-гормоныбелки-рецепторыструктурные белкизащитные белкисократительные белкиПо формеглобулярныефибриллярные Классификация белковПо молекулярной массенизкомолекулярныевысокомолекулярныеПо локализации в клеткецитоплазматическиелизосомальныеядерные и т.д.По локализации в организмебелки Классификация белковПо молекулярной массенизкомолекулярныеВысокомолекулярныеПо локализации в клеткецитоплазматическиелизосомальныеядерные и т.д.По локализации в организмебелки Классификация белков По возможности адаптативно регулировать количество данных белковбелки, синтезирующиеся с постоянной Особенности первичной структурыВ остове полипептидной цепи чередуются жесткие структуры (плоские пептидные группы) Пептидная связь – образуется при взаимодействии аминогруппы одной аминокислоты с карбоксильной группой Первичная структура белкаПоследовательность чередования аминокислотных остатков (все связи ковалентные – пептидные, прочные). Особенности первичной структурыВ остове полипептидной цепи чередуются жесткие структуры (плоские пептидные группы) Особенности пептидной связиКомпланарность – все атомы, входящие в пептидную группу находятся в Последовательность изучения первичной структуры белков.Расщепление полипептидной цепи белка на более короткие фрагменты К слабым взаимодействиям относят:Водородные связи – внутри-и межмолекулярные (эти связи формируют гидрофильные Вторичная структура Вторичная структура это пространственная конфигурация полипептидных цепей, которые стремятся уменьшить α спирализация – это закручивание полипептидноостова вокруг мнимой оси цилиндра по ходу ά-спиральВодородные связи формируют трехмерную вторичную структуру белка и образуются между карбонильной (>С=О) Спираль-клубочекСодержание ά-спирали в белках неодинаково и является индивидуальной особенностью каждой белковой молекулы. Основные особенности ά-спиралиСпиральная конфигурация полипептидной цепи имеет винтовую симметрию (напоминает растянутую спираль Некоторые фибриллярные белки образуют конформацию β – структуры- структуры складчатого листа, то β-структура – Складчатого типа, водородные связи образуются менее системно, формируя гофрированную структуру N-конецС-конецПараллельная β-складчатая укладкаβ-поворотN-конецС-конецАнтипараллельная β-складчатая укладка – боковые радикалы одного слоя помещаются между β – структура Связи, поддерживающие  вторичную структуру:водородныеэлектростатическиегидрофобныеван-дер-ваальсовые Водородные: 	1)    N - H Домены Это более сложные уровни организации вторичной структуры. Они представляют собой обособленные Доменная организация характерна для многих белков. В этих белках находится, как правило Третичная структура-Третичная структура- это способ укладки полипептидной цепи в определенном объеме пространства. Третичная структура поддерживается большим числом слабых связей, энергия которых мала от 1 Третичная структура белкаЭто реальная трехмерная конфигурация, которую принимает в пространстве закрученная спираль Связи, стабилизирующие третичную структуру белкаКовалентные - сильные:дисульфидные (-S-S-боковые радикалы цис);изопептидные или псевдопептидные 2. Полярные – слабые: водородные – между группой –NH2, -OH,-SH бокового радикала Особенности организации третичной структуры.Конформация третичной структуры полипептидной цепи определяется свойствами боковых радикалов Уровни структурной организации белка Четвертичная структураЧетвертичная структура – это способ укладки в пространстве отдельных полипептидных цепей, Стабилизация четвертичной структуры белков.В стабилизации четвертичной структуры принимают участие те же типы Структура белкаКроме последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне важна трёхмерная структура белка, Гемоглобин Гемоглобин Кооперативные изменения конформации протомеровО2 связывается с протомерами Нв через Fe2+, который соединен Кооперативные изменения конформации протомеров Нв при присоединении О2Белки обладают конформационной лабильностью и Гем присоединяется к неполярным радикалам активного центра своими пиррольными циклами, а Эмбриональный и фетальный гемоглобинЭмбриональный гемоглобин синтезируется в эмбриональном желточном мешке через несколько Формы гемоглобинаОксигемоглобин (НвО2) – полностью оксигенированный Нв;Дезоксигемоглобин (Нв) – незамещенная 6 координационная Строение протомеров гемоглобинаАллостерический центрКаждая субъединица имеет центр связывания, где располагается небелковая часть Таким образом: 1.  в центре тетрамерной молекулы Нв находится полость, которую 2,3-Бисфосоглицерат (БФГ) – вещество, синтезируемое в Эр из промежуточного продукта окисления глюкозы Изменение концентрации БФГ – как механизм адаптации организма к гипоксии.Концентрация БФГ в Аллостерическими регуляторами активности Нв, которые присоединяются к аллостерическим центрам (пространственно удаленным от Перенос Н+ и СО2 из тканей в легкие с помощью гемоглобина. Эффект Оксигенирование дезоксигемоглобина в легких, образование и выделение СО2.Увеличение концентрации протонов в среде Конформационные изменения гемоглобина при присоединении кислорода Изменение конформации гемоглобина в результате связывания с кислородом Кривая насыщения гемоглобина кислородом Виды гемоглобина человекаГемоглобин А (НвА) - α 2β2 - основной тип гемоглобина Благодарю за внимание!
Слайды презентации

Слайд 2 История изучения
Белки были выделены в отдельный класс биологических

История изученияБелки были выделены в отдельный класс биологических молекулБелки были выделены

молекулБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в

XVIII векеБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана ФуркруаБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулироватьБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурироватьБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислотБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбуминБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибринБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из кровиБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютенБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницыБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницы. Голландский химик Геррит МульдерБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницы. Голландский химик Геррит Мульдер провёл анализ состава белков и выдвинул гипотезу, что практически все белки имеют сходную эмпирическую формулуБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницы. Голландский химик Геррит Мульдер провёл анализ состава белков и выдвинул гипотезу, что практически все белки имеют сходную эмпирическую формулу. Термин «протеин» для обозначения подобных молекул был предложен в 1838 годуБелки были выделены в отдельный класс биологических молекул в XVIII веке в результате работ французского химика Антуана Фуркруа и других учёных, в которых было отмечено свойство белков коагулировать (денатурировать) под воздействием нагревания или кислот. В то время были исследованы такие белки, как альбумин («яичный белок»), фибрин (белок из крови) и глютен из зерна пшеницы. Голландский химик Геррит Мульдер провёл анализ состава белков и выдвинул гипотезу, что практически все белки имеют сходную эмпирическую формулу. Термин «протеин» для обозначения подобных молекул был предложен в 1838 году сотрудником Мульдера Якобом Берцелиусом.

Антуан Франсуа де Фуркруа,
основоположник изучения белков


Слайд 3 Мономерами белков являются аминокислоты
карбоксильная группа
радикал
аминогруппа

Мономерами белков являются аминокислотыкарбоксильная группарадикаламиногруппа

Слайд 4 Олигопептиды содержат до 20 амк (среди них различают

Олигопептиды содержат до 20 амк (среди них различают ди-, три-, тетра-

ди-, три-, тетра- и т.д. пептиды); Полипептиды содержат от 20

до 50 амк; Белки – полипептидные цепи, объединяющие более 50 амк., и имеющие молекулярную массу свыше 6 тыс.

Слайд 5 Образование пептидной связи
Схематическое изображение образования пептидной связи. Подобная

Образование пептидной связиСхематическое изображение образования пептидной связи. Подобная реакция происходит в

реакция происходит в молекулярной машине по образованию белка — рибосоме.



Слайд 6 Свойства белков








Размер белка может измеряться в числе аминокислот

Свойства белковРазмер белка может измеряться в числе аминокислот или в дальтонахРазмер

или в дальтонахРазмер белка может измеряться в числе аминокислот

или в дальтонах (молекулярная масса), чаще из-за относительно большой величины молекулы в производных единицах — килодальтонах (кДа).

Ig


Hb

инсулин

Ац

глютаминсинтетаза


Слайд 7 - Амфотерность - Способность к ионизации в растворе - Характерной

- Амфотерность - Способность к ионизации в растворе - Характерной константой

константой белков является рI – изоэлектическая точка - Хорошо растворимы

в воде - Способность к денатурации

Слайд 8 Классификация белков
По химическому строению
простые;
сложные;
По выполняемой функции
белки-ферменты
белки-гормоны
белки-рецепторы
структурные белки
защитные белки
сократительные

Классификация белковПо химическому строениюпростые;сложные;По выполняемой функциибелки-ферментыбелки-гормоныбелки-рецепторыструктурные белкизащитные белкисократительные белкиПо формеглобулярныефибриллярные

белки
По форме
глобулярные
фибриллярные


Слайд 9 Классификация белков
По молекулярной массе
низкомолекулярные
высокомолекулярные
По локализации в клетке
цитоплазматические
лизосомальные
ядерные и

Классификация белковПо молекулярной массенизкомолекулярныевысокомолекулярныеПо локализации в клеткецитоплазматическиелизосомальныеядерные и т.д.По локализации в

т.д.
По локализации в организме
белки крови
белки печени
белки сердца и т.д.


Слайд 10 Классификация белков
По молекулярной массе
низкомолекулярные
Высокомолекулярные
По локализации в клетке
цитоплазматические
лизосомальные
ядерные и

Классификация белковПо молекулярной массенизкомолекулярныеВысокомолекулярныеПо локализации в клеткецитоплазматическиелизосомальныеядерные и т.д.По локализации в

т.д.
По локализации в организме
белки крови
белки печени
белки сердца и т.д.


Слайд 11 Классификация белков
По возможности адаптативно регулировать количество данных

Классификация белков По возможности адаптативно регулировать количество данных белковбелки, синтезирующиеся с

белков
белки, синтезирующиеся с постоянной скоростью (конститутивные)
белки, синтез которых может

усиливаться при воздействии факторов внешней среды (индуцибельные)
По продолжительности жизни
очень быстро обновляющиеся
очень медленно обновляющиеся
По схожим участкам первичной структуры и родственным функциям
- семейства белков

Слайд 12 Особенности первичной структуры
В остове полипептидной цепи чередуются жесткие

Особенности первичной структурыВ остове полипептидной цепи чередуются жесткие структуры (плоские пептидные

структуры (плоские пептидные группы) с относительно подвижными участками (-СНR),

которые способны вращаться вокруг связей.
Такие особенности полипептидной цепи влияют на укладку ее в пространстве.

C

H


R

N

H

C

C

O

C

H

R


N

H

C

O


Слайд 13 Пептидная связь – образуется при взаимодействии аминогруппы одной

Пептидная связь – образуется при взаимодействии аминогруппы одной аминокислоты с карбоксильной

аминокислоты с карбоксильной группой другой аминокислоты с выделением молекулы

воды. Это ковалентная связь. Основу цепи составляет повторяющаяся последовательность - CO-NH-CH-
CH3 CH2 - OH
I I - H2O
H2N – CH – COOH + H2N – CH – COOH
аланин серин
CH3 CH2 – OH
I I
H2N – CH – CO - NH – CH – COOH
аланилсерин

Слайд 14 Первичная структура белка
Последовательность чередования аминокислотных остатков (все связи

Первичная структура белкаПоследовательность чередования аминокислотных остатков (все связи ковалентные – пептидные,

ковалентные – пептидные, прочные). Пептидные связи стабилизируют линейную первичную

структуру.

Слайд 15 Особенности первичной структуры
В остове полипептидной цепи чередуются жесткие

Особенности первичной структурыВ остове полипептидной цепи чередуются жесткие структуры (плоские пептидные

структуры (плоские пептидные группы) с относительно подвижными участками (-СНR),

которые способны вращаться вокруг связей.
Такие особенности полипептидной цепи влияют на укладку ее в пространстве.

C

H


R

N

H

C

C

O

C

H

R


N

H

C

O


Слайд 16 Особенности пептидной связи
Компланарность – все атомы, входящие в

Особенности пептидной связиКомпланарность – все атомы, входящие в пептидную группу находятся

пептидную группу находятся в одной плоскости;
Способность существовать в 2-х

резонансных формах (кето- или енольной форме);
Транс-положение заместителей по отношению к С-N-связи;
Способность к образованию водородных связей, причем каждая из пептидных групп может образовывать 2 водородные связи с др.группами, в т.ч. и пептидными.
Исключение составляют пептидные группы пролина и гидроксипролина. Они способны образовать только 1 пептидную связь. Это сказывается на формировании вторичной структуры белка. В местах нахождения данных амк полипептидная цепь легко изгибается, т.к. не удерживается, как обычно, водородной связью.

Слайд 17 Последовательность изучения первичной структуры белков.
Расщепление полипептидной цепи белка

Последовательность изучения первичной структуры белков.Расщепление полипептидной цепи белка на более короткие

на более короткие фрагменты по определенным положениям в его

последовательности (разрыв дисульфидных мостиков и модификация остатков цистеина);

Установление порядка чередования амк в полученных фрагментах-пептидах;

Определение расположения пепдитов с известной амк последовательностью в белковой молекуле.

Самой начальной процедурой является определение числа полипептидных нитей в белковой молекуле - протомеров

Слайд 18 К слабым взаимодействиям относят:
Водородные связи – внутри-и межмолекулярные

К слабым взаимодействиям относят:Водородные связи – внутри-и межмолекулярные (эти связи формируют

(эти связи формируют гидрофильные радикалы);
Ионные связи – образуют полярные

(заряженные) радикалы;
Ван-дер-Ваальсовы силы – гидрофобные силы притяжения;
Гидрофобные взаимодействия – образуют гидрофобные радикалы;
Дисульфидные связи – образуются при сближении 2-х радикалов цистеина

Слайд 19 Вторичная структура
Вторичная структура это пространственная конфигурация полипептидных

Вторичная структура Вторичная структура это пространственная конфигурация полипептидных цепей, которые стремятся

цепей, которые стремятся уменьшить свободную энергию, то есть способ

скручивания полипептидных цепей в пространстве.
Различаем α -спирализацию и β – структуру, беспорядочный клубок.


Слайд 20 α спирализация – это закручивание полипептидно
остова вокруг мнимой

α спирализация – это закручивание полипептидноостова вокруг мнимой оси цилиндра по

оси цилиндра по ходу часовой стрелки, поскольку аминокислоты являются

L изомерами. Шаг спирали – 5,3 А( 0,54 нМ) на каждом витке располагается 3,6 аминокислотных остатка, то есть происходит взаимодействие между 1 и 4 аминокислотным остатком и образование большого числа водородных связей
- С=О….Н-N-

Слайд 21 ά-спираль
Водородные связи формируют трехмерную вторичную структуру белка и

ά-спиральВодородные связи формируют трехмерную вторичную структуру белка и образуются между карбонильной

образуются между карбонильной (>С=О) и иминогруппами (=NH) пептидного остова.

Эти связи образуются очень упорядоченно, формируя спираль, и ориентированы вдоль ее оси. На виток спирали укладывается 3,6 аминокислотных остатка (водородные связи образуются между 1-й и 4-й аминокислотами, преимущественно с короткими боковыми цепями). Расстояние между амк остатками равно 0,15 нм.
ά-Спираль представляет собой самый жесткий тип вторичной структуры и преобладает во многих белках.
Пролин и амк с длинными радикалами нарушают спиралевидную укладку.



Слайд 22 Спираль-клубочек
Содержание ά-спирали в белках неодинаково и является индивидуальной

Спираль-клубочекСодержание ά-спирали в белках неодинаково и является индивидуальной особенностью каждой белковой

особенностью каждой белковой молекулы. Глобулярные белки имеют степень спирализации

порядка 60-70%. Спирализованные участки чередуются с хаотическими клубками; в результате денатурации переходы спираль-клубок увеличиваются. Спирализация цепи затруднена в тех случаях, когда одноименно заряженные амк остатки располагаются в непосредственной близости др. от др., т.к. происходит сильное взаимное отталкивание, что препятствует образованию водородных связей, и в тех случаях, когда в амк остатках имеются большие размеры радикалов (сер, тре, лей), а также при наличие в полипептидной цепи пролина, у которого атом азота входит в состав жесткого кольца, что препятствует вращению вокруг связи N-Cά.

Слайд 23 Основные особенности ά-спирали
Спиральная конфигурация полипептидной цепи имеет винтовую

Основные особенности ά-спиралиСпиральная конфигурация полипептидной цепи имеет винтовую симметрию (напоминает растянутую

симметрию (напоминает растянутую спираль электрической плитки);
Образование водородных связей между

пептидными группами каждого первого и четвертого амк остатков;
Регулярность витка спирали;
Равнозначность всех амк остатков не зависимо от строения их боковых радикалов;
Боковые радикалы амк не участвуют в образовании ά-спирали.
Период регулярности ά-спирали равен 5 виткам или 18 амк остаткам; длина одного периода составляет 2,7 нм.

Слайд 24 Некоторые фибриллярные белки образуют конформацию β – структуры-

Некоторые фибриллярные белки образуют конформацию β – структуры- структуры складчатого листа,

структуры складчатого листа, то есть, последовательный ряд листков, расположенных

под углом друг другу. Она может сформироваться между отдельными полипептидными цепями и может быть параллельной и антипараллельной.

Слайд 25 β-структура –
Складчатого типа, водородные связи образуются менее

β-структура – Складчатого типа, водородные связи образуются менее системно, формируя гофрированную

системно, формируя гофрированную структуру из полипептидной цепи. При этом

участки цепи идут либо в одном, либо в противоположном направлении.
β-структура встречается реже, чем ά-спираль. На схемах изображается в виде широкой плоской стрелки, отмечающей направление от N- к С-концу цепи. Расстояние
между соседними амк остатками по оси составляет 0,35 нм., т.е. в 3 раза больше, чем в ά-спирали, число остатков на виток равно 2. В отрезке полипептидной цепи, образующей β-структуру, находится от 3 до 7 амк остатков, а сама β-структура состоит из 2-6 цепей, хотя их число может быть и большим. Поверхность β-структуры может быть плоской или левозакрученной таким образом, чтобы угол между отдельными отрезками цепи составлял 20-250.

Слайд 26








N-конец
С-конец
Параллельная β-складчатая укладка





β-поворот
N-конец
С-конец

Антипараллельная
β-складчатая укладка – боковые радикалы

N-конецС-конецПараллельная β-складчатая укладкаβ-поворотN-конецС-конецАнтипараллельная β-складчатая укладка – боковые радикалы одного слоя помещаются

одного слоя помещаются между боковыми радикалами другого слоя.


С=О
Н-N

межцепочечные
водородные
связи


Слайд 27 β – структура

β – структура

Слайд 29 Связи, поддерживающие вторичную структуру:
водородные
электростатические
гидрофобные
ван-дер-ваальсовые

Связи, поддерживающие вторичную структуру:водородныеэлектростатическиегидрофобныеван-дер-ваальсовые

Слайд 30 Водородные:
1) N - H

Водородные: 	1)  N - H    H -

H - C

- R
R – C - H C=O
C=O …. H - N
H – N H - C - R


O
2) R – C
O- …. H-O-




3) R-CH2-O …. Н N - С =О
н
4) R-C- O …. H-O-C-R
H

Слайд 31 Домены
Это более сложные уровни организации вторичной структуры.

Домены Это более сложные уровни организации вторичной структуры. Они представляют собой

Они представляют собой обособленные глобулярные участки, соединенные др. с

другом короткими, так называемыми «шарнирными участками» полипептидной цепи.
Доменом называют часть молекулы по структуре напоминающей самостоятельный глобулярный белок.

Супервторичная структура типа бочонка.
а — триозофосфатизомераза; б — домен пируваткиназы


Слайд 32 Доменная организация характерна для многих белков. В этих

Доменная организация характерна для многих белков. В этих белках находится, как

белках находится, как правило несколько структурных доменов, каждый из

которых состоит из 200 амк остатков. В некоторых белках (Ig, сериновые протеиназы), структурные домены сходны по своей первичной структуре, что указывает на возможный механизм дубликации соответствующих генов. В др. белках (гемоглобин) имеются определенные различия. По строению домены в белках разделяют на несколько групп в зависимости от содержания в них ά-спиралей и β-структур.

Слайд 33 Третичная структура-
Третичная структура- это способ укладки полипептидной цепи

Третичная структура-Третичная структура- это способ укладки полипептидной цепи в определенном объеме пространства.

в определенном объеме пространства.


Слайд 34 Третичная структура поддерживается большим числом слабых связей, энергия

Третичная структура поддерживается большим числом слабых связей, энергия которых мала от

которых мала от 1 до 7 кал. Слабые связи:

водородные, электростатические, гидрофобные, Ван-дер-вальсовые:
Связи: а) ионная связь
б) водородная связь
в) гидрофобное взаимодействие
г) дисульфидная связь.

Слайд 35 Третичная структура белка
Это реальная трехмерная конфигурация, которую принимает

Третичная структура белкаЭто реальная трехмерная конфигурация, которую принимает в пространстве закрученная

в пространстве закрученная спираль (за счет гидрофобных связей); у

некоторых белков имеются S-S-связи (бисульфидные).
По форме третичной структуры белки делятся на глобулярные (ά-структура) и фибриллярные (β-структура). Однако конфигурация третичной структуры не дает основания думать, что фибриллярные белки имеют только β-структуру, а глобулярные – ά-спираль.

Слайд 36 Связи, стабилизирующие третичную структуру белка
Ковалентные - сильные:
дисульфидные (-S-S-боковые

Связи, стабилизирующие третичную структуру белкаКовалентные - сильные:дисульфидные (-S-S-боковые радикалы цис);изопептидные или

радикалы цис);
изопептидные или псевдопептидные – между аминогруппой лиз, арг,

и карбоксильной группой боковых радикалов амк асп, глу, аминолимонной кислот (отсюда и название);
эфирные (редко встречающиеся) – между СООН-группами дикарбоновых амк (асп, глу) и ОН-группой гидроксиаминокислот (сер, тре)

Слайд 37 2. Полярные – слабые: водородные – между группой –NH2,

2. Полярные – слабые: водородные – между группой –NH2, -OH,-SH бокового

-OH,-SH бокового радикала одной амк и СООН-группой другой; ионные (электростатические

или солевые) – между –NH3+ лиз, арг, гис и группой СОО- асп и глу кислот; неполярные (гидрофобные связи) – образуются между углеводородными радикалами амк. Эти связи способствуют формированию гидрофобного ядра из неполярных радикалов внутри белковой глобулы. - вандерваальсовые связи

Слайд 38 Особенности организации третичной структуры.
Конформация третичной структуры полипептидной цепи

Особенности организации третичной структуры.Конформация третичной структуры полипептидной цепи определяется свойствами боковых

определяется свойствами боковых радикалов входящих в нее амк (которые

не оказывают заметного влияния на формирование первичной и вторичной структур) и микроокружением, т.е. средой. При укладке полипептидная цепь белка стремится принять энергетически выгодную форму, характеризующуюся минимумом свободной энергии. Поэтому неполярные R-амк остатков, «избегая» воды, образуют как бы внутреннюю часть третичной структуры белка. Полипептидная цепь изгибается в трехмерном пространстве; при ее изгибах нарушается вторичная спиральная конформация. Изгибы цепи образуются в слабых точках (пролин, гидроксипролин, глицин). Только правильная пространственная укладка белка делает его активным.

Слайд 39 Уровни структурной организации белка

Уровни структурной организации белка

Слайд 40 Четвертичная структура
Четвертичная структура – это способ укладки в

Четвертичная структураЧетвертичная структура – это способ укладки в пространстве отдельных полипептидных

пространстве отдельных полипептидных цепей, обладающих одинаковой или разной первичной,

вторичной, третичной структурой и формирующих единое макромолекулярное образование в структурном и функциональном отношениях.
Эту способность белок приобретает при определенном способе пространственного объединения входящих в его состав протомеров образовавшуюся молекулу называемая мультимером, (построены из четного числа протомеров от 2 до 4, реже от 6 до 10,12…).
Субъединица – функционально активная часть молекулы мультимерного белка. Молекула гемоглобина состоит из α -, и β – субчастиц, каждая из которых состоит из 2-х одинаковых α -, и β –полипептидных цепей т.е. молекула гемоглобина состоит из 4-х полипептидных цепей, каждая из которых окружает группу гема.


Слайд 41 Стабилизация четвертичной структуры белков.
В стабилизации четвертичной структуры принимают

Стабилизация четвертичной структуры белков.В стабилизации четвертичной структуры принимают участие те же

участие те же типы взаимодействий, что и в стабилизации

третичной. Контакты между поверхностями субъединиц возможны только за счет полярных групп амк остатков, т.к. при формировании третичной структуры каждой из полипептидных цепей боковые радикалы неполярных амк (составляющих большую часть всех протеиногенных амк) спрятаны внутри субъединицы.
Между их полярными группами образуются многочисленные ионные, водородные и дисульфидные связи, которые прочно удерживают субъединицы в виде организованного комплекса.


Слайд 43 Структура белка
Кроме последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне

Структура белкаКроме последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне важна трёхмерная структура

важна трёхмерная структура белка, которая формируется в процессе фолдингаКроме

последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне важна трёхмерная структура белка, которая формируется в процессе фолдинга (от англ. folding), «сворачивание»). Трёхмерная структура формируется в результате взаимодействия структур более низких уровней.

Слайд 44 Гемоглобин

Гемоглобин

Слайд 45 Гемоглобин

Гемоглобин

Слайд 46 Кооперативные изменения конформации протомеров
О2 связывается с протомерами Нв

Кооперативные изменения конформации протомеровО2 связывается с протомерами Нв через Fe2+, который

через Fe2+, который соединен с 4 атомами N2 пиррольных

колец гема и атомами азота гис F8 белковой части протомера. Связывание О2 с оставшейся свободной координационной связью Fe2+ происходит по другую сторону от плоскости гема в области гис F7 (анологично тому, как это происходит у миоглобина). Гис F7 не взаимодействует с О2, но обеспечивает оптимальные условия для его связывания.



Гис F8-Fe2+

+ О2



Гис F8-Fe2++О2






Слайд 47 Кооперативные изменения конформации протомеров Нв при присоединении О2
Белки

Кооперативные изменения конформации протомеров Нв при присоединении О2Белки обладают конформационной лабильностью

обладают конформационной лабильностью и после перемещения железа и остатков

гис в плоскость гема, происходят конформационные изменения других протомеров, что облегчает присоединение последующих атомов О2. Поэтому, 4-ая молекула О2 присоединяется к Нв в 300 раз легче, чем 1-ая.
Изменения конформации (а следовательно и функциональных свойств) всех протомеров олигомерного белка при присоединении лиганда только к одному из них носит название кооперативных изменений конформации протомеров.





О2



О2



3 О2





О2

О2

О2

О2

дезоксигемоглобин

НвО2 ...........

оксигемоглобин


Слайд 48 Гем присоединяется к неполярным радикалам активного центра своими

Гем присоединяется к неполярным радикалам активного центра своими пиррольными циклами,

пиррольными циклами, а также к радикалу гистидина с помощью

атома Fe. Пиррольные кольца гема расположены в одной плоскости, а ион Fe2+ в неоксигенированном состоянии гемоглобина выступает над плоскостью. При присоединении О2 ион железа погружается в плоскость колец гема. Координационное число железа в составе гема равно 6, причем 4 связи заняты азотами приррольных колец, 5 связывает гем с белком, а 6 – занята тем или иным лигандом.

Слайд 49 Эмбриональный и фетальный гемоглобин
Эмбриональный гемоглобин синтезируется в эмбриональном

Эмбриональный и фетальный гемоглобинЭмбриональный гемоглобин синтезируется в эмбриональном желточном мешке через

желточном мешке через несколько недель после оплодотворения. Тетрамер (2ζ2ε).

Через 2 недели после формирования печени плода начинает синтезироаваться фетальный, или плодный гемоглобин (НвF). Этот гемоглобин имеет тетрамерную структуру (2ά2γ). После рождения ребенка постепенно замещается на НвА, который начинает синтезироваться в клетках костного мозга плода уже на 8-м месяце развития.

Слайд 50 Формы гемоглобина
Оксигемоглобин (НвО2) – полностью оксигенированный Нв;
Дезоксигемоглобин (Нв)

Формы гемоглобинаОксигемоглобин (НвО2) – полностью оксигенированный Нв;Дезоксигемоглобин (Нв) – незамещенная 6

– незамещенная 6 координационная связь железа;
Карбаминогемоглобин - связывание СО2

с Нв. СО2 связывает только N-концевые ά-аминогруппы. Реакция легко обратима. Образование карбаминогемоглобина определяется парциальным давлением СО2 и имеет прямое отношение к транспорту СО2 кровью;
Карбоксигемоглобин (НвСО) – для образования НвСО требуется в 200 раз более низкое парциальное давление СО. Смерть наступает при связывании 70% Нв угарным газом;
Метгемоглобин (met-Нв) – образуется при окислении Fe2+ до Fe3+; не способен присоединять ни О2, ни СО; имеет коричневый цвет.

Слайд 51 Строение протомеров гемоглобина
Аллостерический центр
Каждая субъединица имеет центр связывания,

Строение протомеров гемоглобинаАллостерический центрКаждая субъединица имеет центр связывания, где располагается небелковая

где располагается небелковая часть молекулы – гем. Между протомерами

образуется аллостерический центр (центральная полость) для присоединения регуляторного лиганда гемоглобина – 2,3-бисфосфоглицерата.









ГЕМ

ά1

ά2

β1

β2



Слайд 52 Таким образом: 1. в центре тетрамерной молекулы Нв

Таким образом: 1. в центре тетрамерной молекулы Нв находится полость, которую

находится полость, которую образуют амк остатки всех 4 протомеров; 2.

в молекуле дезоксигемоглобина по сравнению с оксигемоглобином имеются дополнительные ионные связи, соединяющие протомеры. Вследствии этого, размеры центральной полости могут изменяться: увеличиваться в дезокси-Нв и уменьшаться – в окси-Нв; 3. центральная полость является местом присоединения 2,3-БФГ (из-за различия в размерах центральной полости 2,3-БФГ может присоединяться только к дезокси-Нв; 4. 2,3-БФГ имеет сильный (-) заряд и взаимодействует с 5 (+) –заряженными группами 2β-цепей, следовательно, образуется 5 дополнительных ионных связей, что снижает сродство Нв к О2 в 26 раз. В результате происходит высвобождение О2 в капиллярах ткани при низком парциальном давлении О2.

Слайд 53 2,3-Бисфосоглицерат (БФГ) – вещество, синтезируемое в Эр из

2,3-Бисфосоглицерат (БФГ) – вещество, синтезируемое в Эр из промежуточного продукта окисления

промежуточного продукта окисления глюкозы – 1,3-бисфосфоглицерата. В нормальных условиях

БФГ находится в Эр в высоких концентрациях и его суммарная концентрация при циркуляции крови из легких в ткани и обратно не меняется. Количество БФГ в Эр может увеличиваться при недостатке О2 в тканях.

Изменение функциональной активности белка при взаимодействии с другими лигандами вследствие конформационных изменений называется аллостерической регуляцией, а соединения-регуляторы – аллостерическими лигандами.

С

О

О-

С

С

О

Р

О

О

О-

Н

Н

О

Р

О-

О-

О

Н


Слайд 54 Изменение концентрации БФГ – как механизм адаптации организма

Изменение концентрации БФГ – как механизм адаптации организма к гипоксии.Концентрация БФГ

к гипоксии.
Концентрация БФГ в Эр людей, живущих в определенных

климатических условиях – величина постоянная. При подъеме на высоту 4000 м над уровнем моря, концентрация БФГ возрастает уже через 2 дня в 2 раза (4,5-7,0 мМ). Это снижает сродство Нв к О2 и увеличивает количество О2, транспортируемого в ткани.
Такую же адаптацию можно наблюдать у больных с заболеваниями легких, при которых развивается общая гипоксия тканей: при снижении парциального давления от 100 до 50 мм.рт.ст., в Эр усиливается выработка БФГ также в 2 раза, что повышает доставку О2 в ткани.

Слайд 55 Аллостерическими регуляторами активности Нв, которые присоединяются к аллостерическим

Аллостерическими регуляторами активности Нв, которые присоединяются к аллостерическим центрам (пространственно удаленным

центрам (пространственно удаленным от активного центра), помимо 2,3-БФГ являются

Н+ и СО2. При взаимодействии аллостерических лигандов белки меняют свою конформацию (в т.ч. и активного центра) и функцию, что является приспособительной реакцией к постоянно меняющимся условиям внешней среды.

Способность к аллостерической регуляции характерна для олигомерных белков, т.е. необходимо взаимодействие протомеров.
Концентрация аллостерических лигандов снижает сродство Нв к О2.


Слайд 56 Перенос Н+ и СО2 из тканей в легкие

Перенос Н+ и СО2 из тканей в легкие с помощью гемоглобина.

с помощью гемоглобина. Эффект Бора.
Увеличение освобождения О2 Нв в

зависимости от концентрации Н+ называют эффектом Бора

Образовавшийся в тканях СО2 переносится в Эр, где происходит образование из СО2 под действием фермента карбангидразы Н2СО3. при переходе окси-Нв к дезокси-Нв, специфические участки Нв приобретают большое сродство к Н+ - в результате изменения амк окружения этих участков СОО-. Присоединение 3 пар Н+ к Нв уменьшает его сродство к О2 и усиливает транспорт О2 в ткани, нуждающиеся в нем.




Клетки тканей

Капилляры
тканей

эритроцит

СО2

СО2

СО2

Н2СО3

Н+

О2

Н2О

Н2О

НСО3-

Нв О2

Н+Нв

О2

О2


Слайд 57 Оксигенирование дезоксигемоглобина в легких, образование и выделение СО2.
Увеличение

Оксигенирование дезоксигемоглобина в легких, образование и выделение СО2.Увеличение концентрации протонов в

концентрации протонов в среде снижает сродство О2 к гемоглобину

и усиливает его транспорт в ткани.

В капиллярах легких высокое парциальное давление О2 приводит к оксигенированию Нв и удалению 6 протонов. Образующийся СО2 выделяется в альвеолярное пространство и удаляется с выдыхаемым воздухом.
Следовательно, молекула Нв в ходе эволюции приобрела способность воспринимать и реагировать на информацию, получаемую из окружающей среды.




Альвеолярный воздух

Капилляры легких

эритроцит

СО2

СО2

СО2

О2

О2

О2

Н+Нв

Нв(О2)

Н+

Н2СО3

НСО3-

Н2О

Н2О


Слайд 59 Конформационные изменения гемоглобина при присоединении кислорода

Конформационные изменения гемоглобина при присоединении кислорода

Слайд 60 Изменение конформации гемоглобина в результате связывания с кислородом

Изменение конформации гемоглобина в результате связывания с кислородом

Слайд 61 Кривая насыщения гемоглобина кислородом

Кривая насыщения гемоглобина кислородом

Слайд 62 Виды гемоглобина человека
Гемоглобин А (НвА) - α 2β2

Виды гемоглобина человекаГемоглобин А (НвА) - α 2β2 - основной тип

- основной тип гемоглобина у взрослых
Гемоглобин А2 (НвА 2)

- α 2δ2 - минорный тип гемоглобина у взрослых
Гемоглобин F (НвF) - α 2γ2 - основной тип гемоглобина у плода



  • Имя файла: stukurnaya-organizatsiya-belka.pptx
  • Количество просмотров: 141
  • Количество скачиваний: 0