Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Трансляция. Биосинтез белка

Содержание

Часть IСтруктура РНКтРНКРибосома
ТрансляцияБиосинтез белка Часть IСтруктура РНКтРНКРибосома РНК в клеткеDNAProteinsmRNArRNAtRNAmiRNAvault RNAsnRNAsnoRNASRP 7S RNAgRNA7SK RNAncRNAcRNARNAse P RNA vs DNAБактериофаг øR1-37 использует в своей ДНК дезоксиуридин вместо дезокситимидина Вторичная и третичная структура РНКВторичная структура - совокупность комплементарных взаимодействийТретичная структура - 3D-атомарная структура Вторичная структура РНКG≡C (3 Н-связи)A=UG=U Вторичная структура РНКG≡CA=U (2 Н-связи)G=U Вторичная структура РНКG≡CA=UG=U (2 Н-связи) Вторичная структура РНК http://www.eternagame.org/web/ Pseudoknots - псевдоузлыСтруктуры, в которых петля шпильки сама образует шпильку Вопрос:Что будет, если длина шпилек в псевдоузле будет, скажем, 12 нуклеотидов? Адапторная гипотеза (1955)Между мРНК и белками существует адаптор, ставящий в соответствие генетическую информацию и аминокислотыFrancis Crick(1916-2004) Трехбуквенный код (1953)20 аминокислот4 нуклеотида1-битный код: 4 варианта2-битный код: 16 вариантов3-битный код: Универсальный генетический код61 смысловой триплет. Но у человека только 38 разных тРНК. Как такое может быть?! Отклонения от генетического кодаМитохондрии, некоторые бактерии и простейшие Неканонические аминокислотыCеленоцистеин (UGA)Селенометионин (AUG)Пирролизин (UGA) Пространственная структура тРНК Модифицированные нуклеотиды в тРНК2’-O-methyl (A, C, U, G)m7G, m1G, m2G, m2,2G, m5C, Неканонические структуры в РНК Неканонические пары в тРНКhttp://bps.rutgers.edu/bps G-QuadruplexВнутримолекулярные и межмолекулярныеТеломерыПромоторымРНК Неорганические ионы в структуре тРНК Стабильные тетралупыGNRA-tetraloopСтабилизируется стекинг-взаимодействиями TAR HIV-1 Triple contact in TAR Как 38 тРНК могут «обслуживать» 61 кодон?! Wobble-гипотеза (F.Crick, 1966)Объясняет, почему тРНК меньше, чем кодонов Варианты wobble-взаимодействий Неканонические пары в кодон-антикодоновом взаимодействии 3 tRNASer - 6 триплетов Кто заметил ошибку на предыдущем слайде? :) Аминоацил-тРНК синтетазыНекоторые ARSase могут деацилировать неправильно ацилированные тРНК У вас должны были возникнуть вопросы:К какому концу тРНК пришивается аминокислота?Как аминоацил Identity ElementsИзменяя identity elements, можно обмануть ARSase - и она начнет навешивать не ту аминокислоту Созревание тРНК N. equitansДве половинки тРНК закодированы в разных генах на разных хромосомах RNAse PRNP - рибонуклеопротеинRNAse P - рибозимНо! RNAse P из митохондрий человека не содержит RNA Процессинг тРНКtRNA вырезается из транскрипта (Pol III)У архей и эукаритот в tRNA еще есть интрон Аминоацил-тРНКНа 3’-конце всех тРНК находится ССА-триплетОн не закодирован в ДНК, а довешивается пост-транскрипционно Процессинг рибосомных РНК Сравнение прокариотических и эукариотических рибосом Центрифугирование в градиенте сахарозыКоэффициент седиментации (S):зависит от формы частицызависит от массы частицы Сборка рибосомыУмение разбирать и собирать рибосому позволило локализовать на ней многие важные участки 23S rRNA 23S rRNA Структурный анализ рибосом2000 - 70S из Thermus thermophilis, 3Å2000 - 70S из Рибосома E.coli (конец 80-х) Thermus thermophilis 70S (Yusupov et. al, 2001) Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК? 50S ribosome 3 участка связывания тРНК на рибосоме Инициация: тРНК связывается с Р-сайтомЭлонгация: тРНК связывается с А-сайтом Элонгация трансляции. Шаг 1.Инициаторная Мет-тРНК в Р-сайтеА-сайт свободен Элонгация трансляции. Шаг II.P-сайт занят пептидил-тРНКВ А-сайт связывается новая аминоацил-тРНК Элонгация трансляции. Шаг III.Транспептидация.тРНК в Р-сайте без аминокислоты, но пептид - в Элонгация трансляции. Шаг IV.Транслокация.Рибосома перемещается по мРНКВ Е-сайте - деацилированная тРНКВ Р-сайте - пептидил-тРНКА-сайт пустой Рибосомный туннель Конец
Слайды презентации

Слайд 2 Часть I
Структура РНК
тРНК
Рибосома

Часть IСтруктура РНКтРНКРибосома

Слайд 3 РНК в клетке
DNA
Proteins
mRNA
rRNA
tRNA
miRNA
vault RNA
snRNA
snoRNA
SRP 7S RNA
gRNA
7SK RNA
ncRNA

cRNA
RNAse P

РНК в клеткеDNAProteinsmRNArRNAtRNAmiRNAvault RNAsnRNAsnoRNASRP 7S RNAgRNA7SK RNAncRNAcRNARNAse P

Слайд 4 RNA vs DNA


Бактериофаг øR1-37 использует в своей ДНК

RNA vs DNAБактериофаг øR1-37 использует в своей ДНК дезоксиуридин вместо дезокситимидина

дезоксиуридин вместо дезокситимидина


Слайд 5 Вторичная и третичная структура РНК
Вторичная структура - совокупность

Вторичная и третичная структура РНКВторичная структура - совокупность комплементарных взаимодействийТретичная структура - 3D-атомарная структура

комплементарных взаимодействий
Третичная структура - 3D-атомарная структура


Слайд 6 Вторичная структура РНК
G≡C (3 Н-связи)
A=U
G=U

Вторичная структура РНКG≡C (3 Н-связи)A=UG=U

Слайд 7 Вторичная структура РНК
G≡C
A=U (2 Н-связи)
G=U

Вторичная структура РНКG≡CA=U (2 Н-связи)G=U

Слайд 8 Вторичная структура РНК
G≡C
A=U
G=U (2 Н-связи)

Вторичная структура РНКG≡CA=UG=U (2 Н-связи)

Слайд 9 Вторичная структура РНК

Вторичная структура РНК

Слайд 10 http://www.eternagame.org/web/

http://www.eternagame.org/web/

Слайд 11 Pseudoknots - псевдоузлы
Структуры, в которых петля шпильки сама

Pseudoknots - псевдоузлыСтруктуры, в которых петля шпильки сама образует шпильку

образует шпильку


Слайд 12 Вопрос:
Что будет, если длина шпилек в псевдоузле будет,

Вопрос:Что будет, если длина шпилек в псевдоузле будет, скажем, 12 нуклеотидов?

скажем, 12 нуклеотидов?


Слайд 13 Адапторная гипотеза (1955)
Между мРНК и белками существует адаптор,

Адапторная гипотеза (1955)Между мРНК и белками существует адаптор, ставящий в соответствие генетическую информацию и аминокислотыFrancis Crick(1916-2004)

ставящий в соответствие генетическую информацию и аминокислоты
Francis Crick
(1916-2004)


Слайд 14 Трехбуквенный код (1953)
20 аминокислот
4 нуклеотида

1-битный код: 4 варианта
2-битный

Трехбуквенный код (1953)20 аминокислот4 нуклеотида1-битный код: 4 варианта2-битный код: 16 вариантов3-битный

код: 16 вариантов
3-битный код: 64 варианта
Георгий Гамов
(1904-1968)
64 намного больше

чем 20!

Слайд 15 Универсальный генетический код
61 смысловой триплет. Но у человека

Универсальный генетический код61 смысловой триплет. Но у человека только 38 разных тРНК. Как такое может быть?!

только 38 разных тРНК. Как такое может быть?!


Слайд 16 Отклонения от генетического кода
Митохондрии, некоторые бактерии и простейшие

Отклонения от генетического кодаМитохондрии, некоторые бактерии и простейшие

Слайд 17 Неканонические аминокислоты
Cеленоцистеин (UGA)
Селенометионин (AUG)
Пирролизин (UGA)

Неканонические аминокислотыCеленоцистеин (UGA)Селенометионин (AUG)Пирролизин (UGA)

Слайд 18 Пространственная структура тРНК

Пространственная структура тРНК

Слайд 19 Модифицированные нуклеотиды в тРНК
2’-O-methyl (A, C, U, G)
m7G,

Модифицированные нуклеотиды в тРНК2’-O-methyl (A, C, U, G)m7G, m1G, m2G, m2,2G,

m1G, m2G, m2,2G, m5C, m3C
I, ψ, W, rT, D
4-Ac-A
...
http://modomics.genesilico.pl/


Слайд 20 Неканонические структуры в РНК

Неканонические структуры в РНК

Слайд 21 Неканонические пары в тРНК
http://bps.rutgers.edu/bps

Неканонические пары в тРНКhttp://bps.rutgers.edu/bps

Слайд 22 G-Quadruplex
Внутримолекулярные и межмолекулярные
Теломеры
Промоторы
мРНК

G-QuadruplexВнутримолекулярные и межмолекулярныеТеломерыПромоторымРНК

Слайд 23 Неорганические ионы в структуре тРНК

Неорганические ионы в структуре тРНК

Слайд 24 Стабильные тетралупы
GNRA-tetraloop
Стабилизируется стекинг-взаимодействиями

Стабильные тетралупыGNRA-tetraloopСтабилизируется стекинг-взаимодействиями

Слайд 25 TAR HIV-1

TAR HIV-1

Слайд 26 Triple contact in TAR

Triple contact in TAR

Слайд 27 Как 38 тРНК могут «обслуживать» 61 кодон?!

Как 38 тРНК могут «обслуживать» 61 кодон?!

Слайд 28 Wobble-гипотеза (F.Crick, 1966)
Объясняет, почему тРНК меньше, чем кодонов

Wobble-гипотеза (F.Crick, 1966)Объясняет, почему тРНК меньше, чем кодонов

Слайд 29 Варианты wobble-взаимодействий

Варианты wobble-взаимодействий

Слайд 30 Неканонические пары в кодон-антикодоновом взаимодействии

Неканонические пары в кодон-антикодоновом взаимодействии

Слайд 31 3 tRNASer - 6 триплетов

3 tRNASer - 6 триплетов

Слайд 32 Кто заметил ошибку на предыдущем слайде? :)

Кто заметил ошибку на предыдущем слайде? :)

Слайд 33 Аминоацил-тРНК синтетазы
Некоторые ARSase могут деацилировать неправильно ацилированные тРНК

Аминоацил-тРНК синтетазыНекоторые ARSase могут деацилировать неправильно ацилированные тРНК

Слайд 34 У вас должны были возникнуть вопросы:
К какому концу

У вас должны были возникнуть вопросы:К какому концу тРНК пришивается аминокислота?Как

тРНК пришивается аминокислота?
Как аминоацил тРНК синтетаза распознает свою тРНК?


Слайд 35 Identity Elements
Изменяя identity elements, можно обмануть ARSase -

Identity ElementsИзменяя identity elements, можно обмануть ARSase - и она начнет навешивать не ту аминокислоту

и она начнет навешивать не ту аминокислоту


Слайд 36 Созревание тРНК N. equitans
Две половинки тРНК закодированы в

Созревание тРНК N. equitansДве половинки тРНК закодированы в разных генах на разных хромосомах

разных генах на разных хромосомах


Слайд 37 RNAse P
RNP - рибонуклеопротеин
RNAse P - рибозим
Но! RNAse

RNAse PRNP - рибонуклеопротеинRNAse P - рибозимНо! RNAse P из митохондрий человека не содержит RNA

P из митохондрий человека не содержит RNA


Слайд 38 Процессинг тРНК
tRNA вырезается из транскрипта (Pol III)
У архей

Процессинг тРНКtRNA вырезается из транскрипта (Pol III)У архей и эукаритот в tRNA еще есть интрон

и эукаритот в tRNA еще есть интрон


Слайд 39 Аминоацил-тРНК
На 3’-конце всех тРНК находится ССА-триплет
Он не закодирован

Аминоацил-тРНКНа 3’-конце всех тРНК находится ССА-триплетОн не закодирован в ДНК, а довешивается пост-транскрипционно

в ДНК, а довешивается пост-транскрипционно


Слайд 40 Процессинг рибосомных РНК

Процессинг рибосомных РНК

Слайд 41 Сравнение прокариотических и эукариотических рибосом

Сравнение прокариотических и эукариотических рибосом

Слайд 42 Центрифугирование в градиенте сахарозы
Коэффициент седиментации (S):
зависит от формы

Центрифугирование в градиенте сахарозыКоэффициент седиментации (S):зависит от формы частицызависит от массы частицы

частицы
зависит от массы частицы


Слайд 43 Сборка рибосомы
Умение разбирать и собирать рибосому позволило локализовать

Сборка рибосомыУмение разбирать и собирать рибосому позволило локализовать на ней многие важные участки

на ней многие важные участки


Слайд 44 23S rRNA

23S rRNA

Слайд 45 23S rRNA

23S rRNA

Слайд 46 Структурный анализ рибосом
2000 - 70S из Thermus thermophilis,

Структурный анализ рибосом2000 - 70S из Thermus thermophilis, 3Å2000 - 70S


2000 - 70S из Thermus thermophilis, 3,3Å
2000 - 50S

из Haloarcula marismortui, 2,4Å
2001 - 30S из Thermus thermophilis с IF1, 3,2Å
2004 - 80S из Saccharomyces cerevisiae со связанным eEF2, 11,7Å, cryo-EM
2009 - 80S из Thermomyces lanuginosus, 8,9Å, cryo-EM
2010 - 80S из Triticum aestivum, 5,5Å, cryo-EM
2011 - 80S из Saccharomyces cerevisiae, 3Å
2011 - 40S из Tetrahymena thermophila со связанным с ней eIF1, 3,9Å
2013 - 60S из Tetrahymena thermophila со связанным с ней eIF6, 3,5Å
2013 - 80S из Trypanosoma brucei, 5Å, cryo-EM
2013 - 80S из Saccharomyces cerevisiae со связанным eIF5B, 6,6Å cryo-EM
2013 - 40S из Oryctolagus cuniculus со связанными с ней eIF2, eIF3, DHX29, 11,6Å cryo-EM

Слайд 47 Рибосома E.coli (конец 80-х)

Рибосома E.coli (конец 80-х)

Слайд 48 Thermus thermophilis 70S (Yusupov et. al, 2001)

Thermus thermophilis 70S (Yusupov et. al, 2001)

Слайд 49 Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?

Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?

Слайд 50 50S ribosome

50S ribosome

Слайд 51 3 участка связывания тРНК на рибосоме

3 участка связывания тРНК на рибосоме

Слайд 52
Инициация: тРНК связывается с Р-сайтом
Элонгация: тРНК связывается с

Инициация: тРНК связывается с Р-сайтомЭлонгация: тРНК связывается с А-сайтом

А-сайтом


Слайд 53 Элонгация трансляции. Шаг 1.
Инициаторная Мет-тРНК в Р-сайте
А-сайт свободен

Элонгация трансляции. Шаг 1.Инициаторная Мет-тРНК в Р-сайтеА-сайт свободен

Слайд 54 Элонгация трансляции. Шаг II.
P-сайт занят пептидил-тРНК
В А-сайт связывается

Элонгация трансляции. Шаг II.P-сайт занят пептидил-тРНКВ А-сайт связывается новая аминоацил-тРНК

новая аминоацил-тРНК


Слайд 55 Элонгация трансляции. Шаг III.
Транспептидация.
тРНК в Р-сайте без аминокислоты,

Элонгация трансляции. Шаг III.Транспептидация.тРНК в Р-сайте без аминокислоты, но пептид -

но пептид - в Р-сайте
тРНК в А-сайте связана с

пептидом

Слайд 56 Элонгация трансляции. Шаг IV.
Транслокация.
Рибосома перемещается по мРНК
В Е-сайте

Элонгация трансляции. Шаг IV.Транслокация.Рибосома перемещается по мРНКВ Е-сайте - деацилированная тРНКВ Р-сайте - пептидил-тРНКА-сайт пустой

- деацилированная тРНК
В Р-сайте - пептидил-тРНК
А-сайт пустой


Слайд 57 Рибосомный туннель

Рибосомный туннель

  • Имя файла: translyatsiya-biosintez-belka.pptx
  • Количество просмотров: 148
  • Количество скачиваний: 0