Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Каталитический центр рибосомы

Содержание

Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?
Thermus thermophilis 70S (Yusupov et. al, 2001) Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК? 50S ribosome ВопросВ мРНК всегда есть много триплетов, кодирующих метионин, - как понять, с Как рибосома узнает инициаторный кодон? ВопросЧто будет, если удалить последовательность анти-ШД из 16S rRNA? Ответ:Грамм-отрицательные бактерии ничего не заметят и будут жить как ни в чем не бывало! Рибосомный белок S1Связывается с AU-богатыми участками, расположенными upstream от AUG-кодонаСпособен привлекать рибосому без участия ШД Факторы инициацииIF1 - связывается с А-сайтомIF2 - ГТФаза, связывает инициаторную тРНКIF3 - 3 участка связывания тРНК на рибосоме Инициация: тРНК связывается с Р-сайтомЭлонгация: тРНК связывается с А-сайтом Элонгация трансляции. Шаг 1.Инициаторная Мет-тРНК или тРНК с пептидом в Р-сайтеА-сайт свободен Элонгация трансляции. Шаг II.P-сайт занят пептидил-тРНКВ А-сайт связывается новая аминоацил-тРНК Элонгация трансляции. Шаг III.Транспептидация.тРНК в Р-сайте без аминокислоты, но пептид - в Элонгация трансляции. Шаг IV.Транслокация.Рибосома перемещается по мРНКВ Е-сайте - деацилированная тРНКВ Р-сайте - пептидил-тРНКА-сайт пустой GTPase/GAP/GEFGTPase - белок, гидролизующий GTP, активность которого надо регулироватьGAP - GTPase Activating Кто «работает» GAP’ом для IF2? EF-Tu, EF-TsEF-Tu в комплексе с GTP связывает tRNAПосле доставки tRNA в А-сайт ET-Tu и гидролиз GTPТолько в том случае, когда образуется правильное кодон-антикодоновое взаимодействие, Образование пептидной связи EF-GПосле образования пептидной связи необходимо «сдвинуть» рибосому на следующий триплетДля этого необходим Элонгация трансляции у эукариотeEF-1A - сажает тРНК в А-сайт (EF-Tu)eEF-1B - обменивает Терминация трансляцииУ бактерий 3 фактора терминацииRF1 - узнает UAA и UAGRF2 - Molecular mimicry Рибосома и антибиотикиТетрациклин - мешает посадки тРНК в А-сайтХлорамфеникол - ингибирует пептидил-трансферазную СплайсингПроцесс «вырезания» из пре-мРНК некодирующих частей, интронов ИнтроныИнтроны всегда занимают бóльшую часть гена, иногда почти весь генРедкие мРНК не Самосплайсирующиеся интроны I и II группы Самосплайсирующиеся интроны СплайсосомаОгромный комплекс, состоящий из ~150 белков и 5 РНКЭти РНК имеют название snRNA «метят» концы интрона для его вырезания Процессинг 5’-конца мРНКАбсолютно все цитоплазматические мРНК эукариот имеют на 5’-конце так называемый Альтернативный сплайсингПо различным оценкам, от 40% до 75% генов человека могут иметь мРНК эукариот «зациклены»Wells SE et alCircularization of mRNA by eukaryotic translation initiation СканированиеРибосома садится на 5’-конец мРНК и ползет в 3’-сторону («сканирует» мРНК) до Kozak context/Kozak sequenceНе каждый первый AUG-кодон узнается рибосомойСамый хороший AUG-кодон окружен хорошим IRES HCVSiridechadilok B. et alStructural Roles for Human Translation Factor eIF3 inInitiation Frameshift - сдвиг рамки считыванияНа повторяющихся последовательностях типа AAAAAAAAAAAСтруктуры в мРНК могут регулировать сдвиг Как трансляция может регулировать другие процессы в клетке Iron Responsive Element (IRE)Ферритин - белок, «хранящий» железо в клеткеТрансферрин - рецептор, «закачивающий» железо в клетку Регуляция транскрипции при помощи трансляцииТриптофановый оперонСкорость перемещения рибосомы регулирует образование терминаторной структуры Триптофановый оперон E.coli Что досталось нам от бактерий? Транспортно-матричная РНК (тмРНК) тмРНК связывается с пустым А-участком рибосомы, выполняя функции как
Слайды презентации

Слайд 2 Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?

Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?

Слайд 3 50S ribosome

50S ribosome

Слайд 4 Вопрос
В мРНК всегда есть много триплетов, кодирующих метионин,

ВопросВ мРНК всегда есть много триплетов, кодирующих метионин, - как понять,

- как понять, с которого надо начинать синтез белка?


Слайд 5 Как рибосома узнает инициаторный кодон?

Как рибосома узнает инициаторный кодон?

Слайд 6 Вопрос
Что будет, если удалить последовательность анти-ШД из 16S

ВопросЧто будет, если удалить последовательность анти-ШД из 16S rRNA?

rRNA?


Слайд 7 Ответ:
Грамм-отрицательные бактерии ничего не заметят и будут жить

Ответ:Грамм-отрицательные бактерии ничего не заметят и будут жить как ни в чем не бывало!

как ни в чем не бывало!


Слайд 8 Рибосомный белок S1
Связывается с AU-богатыми участками, расположенными upstream

Рибосомный белок S1Связывается с AU-богатыми участками, расположенными upstream от AUG-кодонаСпособен привлекать рибосому без участия ШД

от AUG-кодона
Способен привлекать рибосому без участия ШД


Слайд 9 Факторы инициации
IF1 - связывается с А-сайтом
IF2 - ГТФаза,

Факторы инициацииIF1 - связывается с А-сайтомIF2 - ГТФаза, связывает инициаторную тРНКIF3

связывает инициаторную тРНК
IF3 - мешает субчастицам рибосомы ассоциировать, помогает

распознавать инициаторный кодон

Слайд 10 3 участка связывания тРНК на рибосоме

3 участка связывания тРНК на рибосоме

Слайд 11
Инициация: тРНК связывается с Р-сайтом
Элонгация: тРНК связывается с

Инициация: тРНК связывается с Р-сайтомЭлонгация: тРНК связывается с А-сайтом

А-сайтом


Слайд 12 Элонгация трансляции. Шаг 1.
Инициаторная Мет-тРНК или тРНК с

Элонгация трансляции. Шаг 1.Инициаторная Мет-тРНК или тРНК с пептидом в Р-сайтеА-сайт свободен

пептидом в Р-сайте
А-сайт свободен


Слайд 13 Элонгация трансляции. Шаг II.
P-сайт занят пептидил-тРНК
В А-сайт связывается

Элонгация трансляции. Шаг II.P-сайт занят пептидил-тРНКВ А-сайт связывается новая аминоацил-тРНК

новая аминоацил-тРНК


Слайд 14 Элонгация трансляции. Шаг III.
Транспептидация.
тРНК в Р-сайте без аминокислоты,

Элонгация трансляции. Шаг III.Транспептидация.тРНК в Р-сайте без аминокислоты, но пептид -

но пептид - в Р-сайте
тРНК в А-сайте связана с

пептидом

Слайд 15 Элонгация трансляции. Шаг IV.
Транслокация.
Рибосома перемещается по мРНК
В Е-сайте

Элонгация трансляции. Шаг IV.Транслокация.Рибосома перемещается по мРНКВ Е-сайте - деацилированная тРНКВ Р-сайте - пептидил-тРНКА-сайт пустой

- деацилированная тРНК
В Р-сайте - пептидил-тРНК
А-сайт пустой


Слайд 16 GTPase/GAP/GEF
GTPase - белок, гидролизующий GTP, активность которого надо

GTPase/GAP/GEFGTPase - белок, гидролизующий GTP, активность которого надо регулироватьGAP - GTPase

регулировать
GAP - GTPase Activating Protein - белок, активирующий ГТФазную

активность
GEF - GTP Exchange Factor - белок, обменивающий GDP на GTP

Слайд 17 Кто «работает» GAP’ом для IF2?

Кто «работает» GAP’ом для IF2?

Слайд 18 EF-Tu, EF-Ts
EF-Tu в комплексе с GTP связывает tRNA
После

EF-Tu, EF-TsEF-Tu в комплексе с GTP связывает tRNAПосле доставки tRNA в

доставки tRNA в А-сайт рибосомы GTP гидролизуется и EF-Tu

уходит с рибосомы
Чтобы обменять GDP на GTP нужен GEF, EF-Ts

Слайд 19 ET-Tu и гидролиз GTP
Только в том случае, когда

ET-Tu и гидролиз GTPТолько в том случае, когда образуется правильное кодон-антикодоновое

образуется правильное кодон-антикодоновое взаимодействие, EF-Tu меняет свою конформацию и

приобретает свойство гидролизовать GTP

Слайд 20 Образование пептидной связи

Образование пептидной связи

Слайд 21 EF-G
После образования пептидной связи необходимо «сдвинуть» рибосому на

EF-GПосле образования пептидной связи необходимо «сдвинуть» рибосому на следующий триплетДля этого

следующий триплет
Для этого необходим еще один белок, EF-G, тоже

ГТФаза

Слайд 22 Элонгация трансляции у эукариот
eEF-1A - сажает тРНК в

Элонгация трансляции у эукариотeEF-1A - сажает тРНК в А-сайт (EF-Tu)eEF-1B -

А-сайт (EF-Tu)
eEF-1B - обменивает GDP на GTP (EF-Ts)
eEF2 -

транслоцирует рибосому (EF-G)

Слайд 23 Терминация трансляции
У бактерий 3 фактора терминации
RF1 - узнает

Терминация трансляцииУ бактерий 3 фактора терминацииRF1 - узнает UAA и UAGRF2

UAA и UAG
RF2 - узнает UAA и UGA
RF3 -

помогает работать RF1/2, GTPase
RRF - разрушает пост-терминационную рибосому
У эукариот eRF1 узнает все три кодона
eRF3 - аналог RF3, встречается только у грибов

Слайд 24 Molecular mimicry

Molecular mimicry

Слайд 25 Рибосома и антибиотики
Тетрациклин - мешает посадки тРНК в

Рибосома и антибиотикиТетрациклин - мешает посадки тРНК в А-сайтХлорамфеникол - ингибирует

А-сайт
Хлорамфеникол - ингибирует пептидил-трансферазную активность рибосомы
Эритромицин - «забивает» рибосомный

туннель
Тобрамицин - связывается с А-сайтом, но что делает конкретно не до конца ясно

Слайд 26 Сплайсинг
Процесс «вырезания» из пре-мРНК некодирующих частей, интронов

СплайсингПроцесс «вырезания» из пре-мРНК некодирующих частей, интронов

Слайд 27 Интроны
Интроны всегда занимают бóльшую часть гена, иногда почти

ИнтроныИнтроны всегда занимают бóльшую часть гена, иногда почти весь генРедкие мРНК

весь ген
Редкие мРНК не имеют интронов, например, мРНК белков

теплового шока

Слайд 28 Самосплайсирующиеся интроны I и II группы

Самосплайсирующиеся интроны I и II группы

Слайд 29 Самосплайсирующиеся интроны

Самосплайсирующиеся интроны

Слайд 30 Сплайсосома
Огромный комплекс, состоящий из ~150 белков и 5

СплайсосомаОгромный комплекс, состоящий из ~150 белков и 5 РНКЭти РНК имеют

РНК
Эти РНК имеют название snRNA U1, U2, U4, U5

и U6 (потому что в них много остатков U)
Существует также минорная сплайсосома в состав которой входят также U11, U12 и несколько других...

Слайд 31
snRNA «метят» концы интрона для его вырезания

snRNA «метят» концы интрона для его вырезания

Слайд 32 Процессинг 5’-конца мРНК
Абсолютно все цитоплазматические мРНК эукариот имеют

Процессинг 5’-конца мРНКАбсолютно все цитоплазматические мРНК эукариот имеют на 5’-конце так

на 5’-конце так называемый «кэп» (от англ. cap)
Метилированный по

7-му положению гуанозин присоединен к мРНК через необычную 5’-5’ связь

Слайд 33 Альтернативный сплайсинг
По различным оценкам, от 40% до 75%

Альтернативный сплайсингПо различным оценкам, от 40% до 75% генов человека могут

генов человека могут иметь альтернативно сплайсированные транскрипты
Также известны случаи

альтернативного полиаденилирования

Слайд 34 мРНК эукариот «зациклены»
Wells SE et al
Circularization of mRNA

мРНК эукариот «зациклены»Wells SE et alCircularization of mRNA by eukaryotic translation

by eukaryotic translation initiation factors. Mol Cell. 1998 2:135-40.
eIF4F связывается

на 5’-конце мРНК
PABP связывается на 3’-конце мРНК
eIF4F связывается с PABP

Слайд 35 Сканирование
Рибосома садится на 5’-конец мРНК и ползет в

СканированиеРибосома садится на 5’-конец мРНК и ползет в 3’-сторону («сканирует» мРНК)

3’-сторону («сканирует» мРНК) до тех пор, пока не найдет

AUG-кодон

Слайд 36 Kozak context/Kozak sequence
Не каждый первый AUG-кодон узнается рибосомой
Самый

Kozak context/Kozak sequenceНе каждый первый AUG-кодон узнается рибосомойСамый хороший AUG-кодон окружен

хороший AUG-кодон окружен хорошим контекстом: A/GCC AUG A/G
Еще лучше,

если в 10-15 нуклеотидах после AUG есть шпилька

Слайд 37 IRES HCV
Siridechadilok B. et al
Structural Roles for Human

IRES HCVSiridechadilok B. et alStructural Roles for Human Translation Factor eIF3

Translation Factor eIF3 in
Initiation of Protein Synthesis
Science. 2005 310:

1513-1515

Christian M. T. Spahn et al
Hepatitis C Virus IRES RNA-Induced Changes in the
Conformation of the 40S Ribosomal Subunit
Science. 2003 291 1959-1962


Слайд 38 Frameshift - сдвиг рамки считывания
На повторяющихся последовательностях типа

Frameshift - сдвиг рамки считыванияНа повторяющихся последовательностях типа AAAAAAAAAAAСтруктуры в мРНК могут регулировать сдвиг

AAAAAAAAAAA
Структуры в мРНК могут регулировать сдвиг


Слайд 39 Как трансляция может регулировать другие процессы в клетке

Как трансляция может регулировать другие процессы в клетке

Слайд 40 Iron Responsive Element (IRE)
Ферритин - белок, «хранящий» железо

Iron Responsive Element (IRE)Ферритин - белок, «хранящий» железо в клеткеТрансферрин - рецептор, «закачивающий» железо в клетку

в клетке
Трансферрин - рецептор, «закачивающий» железо в клетку


Слайд 41 Регуляция транскрипции при помощи трансляции
Триптофановый оперон
Скорость перемещения рибосомы

Регуляция транскрипции при помощи трансляцииТриптофановый оперонСкорость перемещения рибосомы регулирует образование терминаторной структуры

регулирует образование терминаторной структуры


Слайд 42 Триптофановый оперон E.coli







Триптофановый оперон E.coli

Слайд 43 Что досталось нам от бактерий?

Что досталось нам от бактерий?

  • Имя файла: kataliticheskiy-tsentr-ribosomy.pptx
  • Количество просмотров: 118
  • Количество скачиваний: 0