через 8 лет после открытия Японии командором Мэтью Перри,
стал первым еврейским поселенцем.Спустя восемь лет в городе обосновались 50 еврейских семей из Польши, США и Англии. К концу ХIХ столетия появились две еврейские общины: в Кобэ, где преобладали сефарды, и в Нагасаки, где преобладали выходцы
из России. Еврейская община в Нагасаки была создана в 1896 году. К началу ХХ века она насчитывала 100 человек. В 1917-1918 годах прибыли тысячи евреев-беженцев из России и других стран. Япония стала перевалочным пунктом для них на пути в Америку.
В 1940-41 году прибыло еще несколько тысяч беженцев из Германии.