Слайд 2
Данные Госсанэпиднадзора РФ
Слайд 3
Этиологическая структура ОКИ
в Новосибирске, 2005-2008 гг.
Данные получены
в ГНЦ ВБ «Вектор», ИХБФМ СО РАН, НИЧ НГУ
Слайд 4
Семейство Астровирусов (Astroviridae)
Astron – звезда, от звездчатой формы
вирионов, видимых при электронной микроскопии
Слайд 5
Астровирусы – РНК содержащие вирусы
размером около 28нм.
Фосфолипидная оболочка отсутствует,
под электронным микроскопом видна звёздчатая структура
T. W. Lee and J. B. Kurtz.
Слайд 6
Характеристика вирионов
Форма – сферическая, икосаэдрическая симметрия; похож на
6-конечную звезду Давида
Размеры (диаметр) – 27-34 нм, в зависимости
от источника выделения и способа культивирования
Липидная оболочка – отсутствует
Звездчатые структуры присутствуют лишь у 10% вирионов, видимых при ЭМ
Слайд 7
Характеристика вирионов (2)
Инфекционность – нечувствительны к органическим растворителям
(хлороформ) и детергентам (ионным, неионным и цвиттерионным).
Устойчивы в интервалах
рН, начиная с рН=3,0, и до 7,0.
Содержат 3 вирионных белка.
Слайд 8
История
Астровирусы были открыты Madeley and Cosgrove в 1975
г при исследовании фекальных экстрактов больных гастроэнтеритом методом прямой
электронной микроскопии.
Важной вехой в изучении астровирусов явилось культивирование астровирусов на культуре клеток (1981 г Lee and Kurtz)
В 1984 г выделено 5 серотипов астровирусов (Lee, Kurtz)
Конец 80х годов ознаменовался разработкой ИФА для диагностики астровирусного АГ в фекалиях (Herrmann J E, Nowak N.A, Perron-Henry D.M)
В 1993 г астровирусы были выделены в отдельное семейство Astroviridae (Monroe SS, Jiang B, Stine SE 1993)
Слайд 9
Family Astroviridae
Genus Mamastrovirus
Bovine astrovirus types 1,2
Human astrovirus (1-8)
Ovine
astrovirus
Porcine astrovirus
Mink astrovirus
Feline astrovirus
Genus Avastrovirus
Duck astrovirus
Turkey
astrovirus types 1.2
Avian nephritis virus 1
Avian nephritis virus 2
Слайд 10
Организация генома астровирусов
Слайд 11
Классификация астровирусов человека
Слайд 12
Эпидемиологические особенности по литературным данным
Астровирусы распространены по всему
миру. Источником инфекции является человек с клинически выраженной или
бессимптомной формами заболевания. Носительство астровирусной инфекции не доказано. Передаются астровирусы посредством фекально-орального механизма передачи, возможен также контактно-бытовой механизм. Заражение происходит при употреблении контаминированной воды, продуктов питания. Астровирусная инфекция преимущественно поражает детей, пожилых людей и лиц с иммунодефицитом. Среди причин вирусного гастроэнтерита у детей до 5 лет астровирусная инфекция занимает второе место после ротавирусов (Glass 2000; A. Palombo, F. Bishop 1996; O.Giordano, L. Ferreyra 2001) .
Пик заболеваемости регистрируется зимой в регионах с умеренным климатом и в сезон дождей в странах с тропическим климатом.
Слайд 13
Особенности клинической картины по литературным данным
Инкубационный период астровирусной
инфекции составляет 3-4 дня.
Клиническая картина характеризуется:
диареей,
рвотой,
абдоминальной
болью,
субфебрильной лихорадкой,
астеническим синдромом.
Длительность заболевания 2-3 дня, характерно циклическое течение.
Слайд 14
Методы диагностики
Вирусологический
Серологический (либо наличие антигена, либо наличие антител
к антигену)
Электронная микроскопия
ОТ-ПЦР
Слайд 15
Возрастное распределение
Возраст в месяцах
Количество случаев
Данные получены в
ГНЦ ВБ «Вектор», ИХБФМ СО РАН, НИЧ НГУ
Слайд 16
Лечение
Только симптоматическое: регидратация и диета
Иммунитет
Стойкий
Вакцины
Пока не разработаны
Слайд 17
Семейство Калицивирусов (Caliciviridae)
Calix – чаша, от чашевидных впадин,
видных в ЭМ
Слайд 18
Калицивирусы
при электронной микроскопии
Слайд 19
Характеристика вирионов
Форма – сферическая, икосаэдрическая симметрия; похож на
6-конечную звезду Давида
Размеры (диаметр) – 35-39 нм
Липидная оболочка –
отсутствует
Способ проникновения в клетку – пока не изучен, скорее всего - эндоцитоз
Репликация – в цитоплазме
Сборка вирионов, локализация - пока не изучены
Выход из клетки – секреторными путями, экзоцитоз
Слайд 20
Характеристика вирионов (2)
Инфекционность – нечувствительны к органическим растворителям
(хлороформ) и детергентам (ионным, неионным и цвиттерионным).
Устойчивы в интервалах
рН, начиная с рН=4, и до 8,0.
Содержат 2-3 вирионных белка.
Слайд 21
История открытия
Эпидемические гастроэнтериты с высоким уровнем повторной заболеваемости
были описаны в США в 1929 г.
Получили название “Winter
vomiting disease”
Патоген, вызывающий небактериальные гастроэнтериты, впервые обнаружен при электронной криомикроскопии в 1972 г.,
Dr. A. Kapikian (образцы 1968 г. из Норфолка)
Первые полные геномные последовательности – 1993 г. (Norwalk, Southampton)/
Слайд 22
Таксономия семейства Caliciviridae: 4 рода
Слайд 23
Организация генома Калицивирусов
Геном - одноцепочечная +РНК, длиной от
7400 до 8300 нукл.
5’-NCR - 80-85 нуклеотидов, имеет ковалентно-связанный
белок вместо «кэпа» - VpG.
3’-NCR - от 80 до 85 нуклеотидов, содержит полиА на 3’-конце
Слайд 24
Стратегия норовирусов
Схема организации главного белка капсида норовирусов
Сходство
последовательностей разных изолятов норовирусов: домен S - 30%, субдомен
P1 – 11%, субдомен P2 – 8%
Структура вириона норовирусов,
построенная на основе крио-электронного
и рентгенокристалло-графического исследования норовирусных ВПЧ.
Структура вирусного белка капсида, формирующего оболочку вируса
[Le Pendu et al., 2006]
Слайд 25
Генетическая неоднородность
Геногруппы калицивирусов
Слайд 26
Природные хозяева,
механизм передачи
Передаются фекально-оральным путем
Инфекционная доза очень
низкая (до 10 вирионов)
Инкубационный период – 1-2 дня
Болезнь у
человека – 1-3 дня диареи, сопровождается рвотой, лихорадкой, болями в животе и анорексией (отсутствие аппетита). Иногда случаются насморк, простуда, головная боль, чувство усталости, мускульные боли. Поэтому эту болезнь иногда называют «кишечным гриппом»
Выздоровевший может продолжать выделять вирус
от 3 дней до 2 недель
Смерть – исключительно редка
Слайд 27
Лабораторная диагностика
Электронная микроскопия – вирус в фекалиях.
ИФА -
наличие антигена в фекалиях или в крови (только в
острой фазе).
ОТ-ПЦР – начиная с 1-го дня, до 3-х недель
По наличию антител класса IgG в сыворотке крови – выявление перенесенной болезни в прошлом (2-3 месяца)
Слайд 28
Возрастное распределение
Возраст в месяцах
Количество случаев
Данные получены в
ГНЦ ВБ «Вектор», ИХБФМ СО РАН, НИЧ НГУ
Слайд 29
Лечение
Только симптоматическое: регидратация, исключение молока
Иммунитет
Нестойкий
Вакцины
Пока не разработаны
Слайд 30
СЕМЕЙСТВО Parvoviridae
Электронные микрофотографии получены в ИХБФМ СО РАН
Слайд 31
Таксономическая ситуация внутри семейства
Подсемейство Parvovirinae (вирусы позвоночных)
Род Dependovirus
(необходима ко-инфекция адено- или герпесвирусами)
Адено-ассоциированные вирусы (AAV) типов 1-5
человека, птиц, коров, собак, лошадей, овец
Род Erythrovirus
Парвовирус человека В19 и другие парвовирусы человекеа
Парвовирус свинохвостых макак, парвовирус макак-резусов
Род Parvovirus
Парвовирус собак, вирус панлейкопении кошек
Вирус энтерита норок
Парвовирус хомячков, парвовирусы цыплят, вирус панлейкемии кошек, Н-1 парвовирус и другик парвовирусы свиней и др.
Род Amdovirus
Вирус Алеутской болезни норок
Род Bocavirus
Bovine parvovirus
Canine minute virus
Human bocavirus 1 – respiratory
Human bocavirus 2-4 – in stool
Подсемейство Densovirinae (вирусы насекомых)
Род Iteravirus
Род Brevidensovirus
Род Densovirus
Род Pefudensovirus
Слайд 32
Характеристики вирионов
Изометрический вирион имеет сферическую форму диаметром от
21 до 26 нм с икосаэдрической симметрией.
Не имеют липидной
оболочки
Два структурных белка VP1 и VP2 образуют вирусный капсид, который на самом деле на 95% состоит из белка VP2. При этом VP1 отличается от белка VP2 только по N-концевой части, добавлением 227 аминокислот, которые в основном локализуются снаружи вириона и доступны для связывания с антителами.
В состав вириона входит еще и белок VP3
Неструктурный белок NS1 по всей видимости вовлечен в вирусную репликацию, активацию транскрипции вирусных белков и индукцию апоптоза в клетках-мишенях инфекции.
Вирионы устойчивы в интервалах рН от 3 до 9, а также довольно устойчивы к температуре, не теряя активности в течение часа при 56°С
Вирус может быть инактивирован обработкой формалином, бета-пропиолактоном, гидроксиламином и окислителями
Слайд 33
Геном парвовирусов
Линейная одноцепочечная ДНК длиной от 4 до
6,3 тысяч оснований. В вирионе может содержаться либо +-цепь,
либо –цепь, а иногда – по 50%
5’ и 3”-концы содержат палиндромные последовательности 120-550 нуклеотидов
Депендовирусы содержат одну рамку считывания, а некоторые денсовирусы - две рамки считывания: левую и правую, у бокавирусов три рамки считывания.
Левая рамка кодирует по крайней мере один неструктурный белок, а правая – два капсидных белка: VP1 и VP2
Слайд 34
Организация генома парвовирусов
Схема приведена для адено-ассоциированного вируса
Слайд 35
Жизненный цикл парвовирусов
Связывание с клеточным рецептором и проникновение
путем эндоцитоза
Созревание эндосомы до лизосомы и выход модифицированного вириона
из лизосомы
Связывание вириона с ядерными порами и проникновение гДНК в ядро
Достраивание гДНК до двуцепочечного состояния и репликация
Транскрипция в ядре, альтернативный сплайсинг и трансляция
Вход синтезированных белков капсида в ядро
Сборка вирионов и выход из ядра и клетки
Слайд 36
Биомедицинские свойства вирусов
Вирус В19 является потенциальным ингибитором гематопоэза,
потому что он литически инфицирует клетки-предшественники эритроцитов. Клеточными рецепторами
для этого вируса служат остатки глобозида или Р-антиген. Они найдены на клетках-предшественниках эритроцитов, синовиальных клеток, клеток плацентарной ткани, клеток миокарда плода человека и эндотелиальных клеток.
По имеющимся данным вирусная репликация ограничена клетками-предшественниками эритроцитов. Дело в том, что одного наличия глобозида недостаточно для входа вируса в клетку, а для этого необходимо его соседство с ко-рецептором вируса – альфа-5-бета-1-интегрином, а также необходима функциональная активность бета-интегрина.
Недавние исследования показали, что аутоантиген Ku80 также может служить рецептором. NS1-белок этого вируса, как уже сказано выше, участвует в индуцировании смерти клеток.
Слайд 37
Парвовирус В19
Инфицирование этим вирусом обычно происходит респираторным путем,
но он может также передаваться через кровь и продукты
ее переработки и вертикально – от матери к плоду. Однако, вертикальной трансмиссии не бывает, если мать имела иммунитет во время экспозиции с вирусом.
Слайд 38
Эпидемиология инфекции.
Данная инфекция широко распространена в мире; ее
пики приходятся на весну, и наиболее масштабные эпидемии происходят
раз в четыре года.
Встречаемость (prevalence) IgG-антител среди различных возрастных групп населения варьирует следующим образом: от 2 до 15% у детей от 1 до 5 лет, 15-60% - у детей от 6 до 19 лет, 30-60% - у взрослых и более 85% у престарелых (более 65 лет).
Более 35% женщин детородного возраста не имеет иммунитета против этой инфекции.
Обычно эта инфекция встречается у беременных в 1-2% случаев, а вертикальная передача случается в 33-51% случаев. Риск нарушений плода при этом – около 10%.
Данная инфекция обусловливает 48 случаев гибели плода в Нидерландах в год.
Слайд 39
Эпидемиологические данные по бокавирусам человека в Новосибирске
Встречаемость у
детей раннего возраста менее 2%
Почти половина бокавирусов встречаются в
инфекциях сочетанной этиологии
Почти 34% – бокавирусы первого генотипа, оставшиеся 66% - бокавирусы второго генотипа
Бокавирусы других генотипов на территории Новосибирска зарегестрированны не были