Презентация на тему Контроль экспрессии. Транскрбция.

участки хроматин, находящиеся в течение клеточного цикла в конденсированном (компактном)

состоянии. Особенностью гетерохроматиновой ДНК является крайне низкая транскрибируемось.

Эухроматин, активный хроматин — участки хроматина, сохраняющие деспирализованное состояние элементарных дезоксирибонуклеопротеиднных нитей (ДНП) в покоящемся ядре, т. е. в интерфазе (в отличие от других участков, сохраняющих спирализованное состояние — гетерохроматина).

Экспрессия генов — преобразование наследственной информации от гена в функциональный продукт — РНК или белок.

за синтез одной полипептидной цепи

Ген – участок молекулы отвечающий

за синтез одного белка

Генотип – Совокупность всех генов организма

не содержит информации о последовательности аминокислот белка.
Экзон — это последовательность ДНК, которая обычно

представлена в зрелой РНК. При альтернативном сплайсинге некоторые экзоны удаляются из зрелой РНК.

правильной укладке нуклеосомной цепи в высшие структуры хроматина
в

прикреплении хромосом к аппарату центриолей и т. д.

Другие некодирующие участки ДНК служат специфиче­скими локусами связывания определенных белков
Промотор
Оператор (Сайленсер)
Энхансер

Наконец, в ДНК могут содержаться короткие локусы, служащие сигналами об окончании (терминации) транскрип­ции ДНК.
Терминатор
Аттенюатор

которой синтезируется мРНК (комплементарна ей)
Кодирующая цепь – по составу

нуклеотидов совпадает с мРНК (учитывая замену Урацила на Тимин)

единицей кода является сочетание трёх нуклеотидов (триплет, или кодон).

Непрерывность — между

триплетами нет знаков препинания, то есть информация считывается непрерывно.

Неперекрываемость — один и тот же нуклеотид не может входить одновременно в состав двух или более триплетов (не соблюдается для некоторых перекрывающихся генов вирусов, митохондрий и бактерий, которые кодируют несколько белков, считывающихся со сдвигом рамки).

Однозначность (специфичность) — определённый кодон соответствует только одной аминокислоте (однако, кодон UGA у Euplotes crassus кодирует две аминокислоты — цистеин и селеноцистеин)[11]

Вырожденность (избыточность) — одной и той же аминокислоте может соответствовать несколько кодонов.

Универсальность — генетический код работает одинаково в организмах разного уровня сложности — от вирусов до человека (на этом основаны методы генной инженерии; есть ряд исключений, показанный в таблице раздела «Вариации стандартного генетического кода» ниже).

оператору, поэтому РНК-П не может начать транскрипцию (оперон выключен).
При накоплении

метаболита (S) в клетке некоторое его количество связывается с белком-репрессором и понижает его сродство к оператору. Оперон включается и синтезируются ферменты для расщепления S.
Репрессибельные опероны
Регулятором служит конечный продукт (Р)
В отсутствие этого продукта белок-репрессор имеет низкое сродство к оператору, поэтому РНК-П транскрибирует гены оперона. Оперон включен и синтезируются ферменты, способствующие образованию вещества Р.
При накоплении данного в-ва некоторое его кол-во связывается с белком-репрессором и повышает его сродство к оператору. Оперон выключается и синтез ферментов прекращается.

(в т. ч. ферменты), постоянно необходимые клетке. Эти белки (как

и гены) тоже называются конститутивными. Для кишечной палочки к подобным белкам относятся, например, ферменты метаболизма глюкозы. Но скорость транскрипции различных конститутивных генов может не совпадать! Этому может быть несколько причин.
Различная сила «промотора»
Роль сигма-фактора

счет природы промотора, природы сигма-фактора РНК-полимеразы, а также, как

мы увидим на примере лактозного оперона, специального белка САР);
регуляция перемещения связавшейся РНК-полимеразы от промотора к собственно генам (при «чисто» оперонном механизме регуляции).
 

(необходим для проникновения лактозы в клетку)

Трансацетилаза

САР (catabolism activating protein) -изменяет структуру промотора резко повышая его сродство с РНК- полимеразой.

Вспомогательные ферменты :
Аденилатциклаза (приводит АТФ в цАТФ)

с промотором в области тата-бокса)
TAF (TBP-associated factor) Вместе с TBP

образую Комплекс TFIID (Transcription Factors of RNA polymerase II) который и является общим фактором транскрибци.

(т. е. неразветвленные) полинуклеотиды с тем же принципом организации:
Тимин

заменяется урацилом
В состав РНК входит рибоза, а не дезоксирибоза
Малекуа является одноцепочечной (за исключением коротких участков – шпиле» )
Наличие «модифицированных нуклиотидов»

Терминирующий кодон
3ʼнетранслируемый участок
Поли(А)-фрагмент

три вида этого фермента: РНК-полимераза I - для синтеза пре-рРНК. РНК-полимераза

II - для синтеза пре-мРНК РНК-полимераза III — для синтеза пре-тРНК

Имеются и принципиальные отличия от синтеза ДНК. а) Асимметричность процесса: в качестве матрицы, как мы знаем, используется лишь одна цепь ДНК. Не совсем ясно, как ферментная система осуществляет правильный выбор нужной це­пи. Видимо, ключевую роль тут играют какие-то последователь­ности нуклеотидов на одной из цепей, узнаваемые системой. б) Консервативность процесса: молекула ДНК по оконча­нии синтеза РНК возвращается в исходное состояние. При син­тезе же ДНК молекулы наполовину обновляются, что делает ре­пликацию полуконсервативной. в) Наконец, синтез РНК не требует для своего начала ника­кой затравки, тогда как при репликации ДНК необходима РНК- затравка.

или ГТФ сохраняя свои фосфатные остатки.
Присоединение следующего нуклеотида цепи.
Отсоединение

факторов транскрибции

растущей цепи пре- РНК до окончательного размера. Это происходит по

мере продвижения РНК-полимеразы по ДНК. Соответственно, перемещается и транскрипционный «глазок», т. е. участок локального расплетения ДНК. На транскрибированной же части ДНК двухцепочечная спи­ральная структура восстанавливается сразу после ухода РНК- полимеразы. Примерная скорость движения фермента и синтеза РНК — 30 нуклеотидов в секунду.

служат специальные ГЦ-богатые участ­ки в конце генов. Поскольку сила

взаимодействия пар ГЦ до­вольно велика, локальная денатурация таких участ­ков в ДНК происходит трудней. Это замедляет продвижение РНК -полимеразы и может служить для нее сигналом к прекра­щению транскрипции. Но еще до окончания процесса в конце новосинтезированной РНК тоже успевает появиться ГЦ богатый участок. Благо­даря взаимодействиюмежду своими нуклеотидами, он образует «шпильку».  Т. е. взаимодействия с нуклеотидами матричной цепи ДНК заменяются на «внутришпилечные» взаимодействия. Это облегчает отсоединение РНК от ДНК.