Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Основные аспекты применения информационно математических механизмов Алана Тьюринга в молекулярной биологии

Содержание

5. Имитация Теория морфогенеза Алана Тьюринга находит подтверждение во многих работах современных ученых. Как в скором будущем можно использовать теорию Тьюринга для исправления врожденных аномалий развития (например, фокомелии)? Четко опишите главные принципы предложенного Вами метода. Какие
Турнир Медиков 2015 Команда: Студенческие инновации(Капитан: Трейгер Георгий)Южно-Уральский Государственный Медицинский УниверситетЧелябинскМисюкевич Наталья Дмитриевна, 5. Имитация Теория морфогенеза Алана Тьюринга находит подтверждение во многих работах современных ЦельРазработать основные аспекты применения информационно - математических механизмов Алана Тьюринга в молекулярной Основные определенияМорфогенез – формообразование, возникновение новых форм и структур как в онтогенезе, С чего все началось?Алан Тьюринг, один из величайших математиков (родился в 1912 Первая гипотеза о теории Хаоса Тьюринг использовал математические уравнения для описания живого Теорию Хаоса подтвердили: Борис Белоусов (в процессе своих исследований, обнаружил кое-что очень странное. Гипотеза Мандельброта одна и та же форма повторяется во всё меньших и меньших масштабах  ветви деревьев. Они Математический принцип самоподобия Тьюринга-одна и та же форма повторяется во всё меньших и меньших масштабах.  Информацонно-биологическая концепция морфогенеза• Морфоген • Распределение сигнала • Реакция • Начальные данные МорфогенУсловно понятие морфоген можно разделить на:АКТИВАТОРстимулирует образование второго вещества и себя по Баланс самоорганизацииУстойчивый паттерн --? спонтанное изменение---?новый паттернПовторение одних и тех же элементов Можно предположить, что в молекулярной биологии роль активаторов и ингибиторов играют гены.То Экспериментальное изучениеЭта гипотеза была проверена учеными из Канады* с помощью генно-инженерного эксперимента Последовательно отключая эти гены была выведена закономерность изменения пальцев кисти у мыши. Таким образом:ПАТТЕРН 1СЛУЧАЙНОЕ МИНИМАЛЬНОЕ ИЗМЕНЕНИЕПАТТЕРН 2 Практическое применениеФокомелия (тюленеобразные конечности) — отсутствие проксимальных и (или) средних частей конечности Применение в медицинеГен, отвечающий за нормальную длину трубчатой кости при развитии конечности Модель экспериментаПроведение генно-инженерного эксперимента на животных в 3 этапа:Отключение гена CiF8 по Применение в медицинеПри успешном обнаружении этих 2групп генов (активатор – ингибитор) и Что для этого необходимо: «Может ли взмах крыльев бабочки в Бразилии вызвать торнадо в Техасе?»Эдвард Лоренц «эффект бабочки» вызывает БЛАГОДАРЮ ЗА ВНИМАНИЕ!
Слайды презентации

Слайд 2 5. Имитация
Теория морфогенеза Алана Тьюринга находит подтверждение

5. Имитация Теория морфогенеза Алана Тьюринга находит подтверждение во многих работах

во многих работах современных ученых. Как в скором будущем

можно использовать теорию Тьюринга для исправления врожденных аномалий развития (например, фокомелии)? Четко опишите главные принципы предложенного Вами метода. Какие условия необходимы, чтобы Ваша идея могла быть реализована на практике?

Слайд 3 Цель
Разработать основные аспекты применения информационно - математических механизмов

ЦельРазработать основные аспекты применения информационно - математических механизмов Алана Тьюринга в

Алана Тьюринга в молекулярной биологии и внутриутробной коррекции анатомических

дефектов

Слайд 4 Основные определения
Морфогенез – формообразование, возникновение новых форм и

Основные определенияМорфогенез – формообразование, возникновение новых форм и структур как в

структур как в онтогенезе, так и в филогенезе организмов.

животные растения
Биологический паттерн – особенность анатомической структуры или морфологии ткани, органа или организма*

Биологический энциклопедический словарь


Слайд 5 С чего все началось?
Алан Тьюринг, один из величайших

С чего все началось?Алан Тьюринг, один из величайших математиков (родился в

математиков (родился в 1912 году, в Лондоне), открыл множество

фундаментальных понятий, лежащих в основе современных компьютеров. С точки зрения Тьюринга, окружающий мир состоит из кодов, которые можно разгадать и в результате своих трудов, был вознагражден: он открыл уравнения, которые описывали живые процессы

Слайд 6 Первая гипотеза о теории Хаоса
Тьюринг использовал математические уравнения

Первая гипотеза о теории Хаоса Тьюринг использовал математические уравнения для описания

для описания живого процесса.
Первая гипотеза о теории Хаоса
Теория хаоса

утверждает, что система, которая полностью описана математическими уравнениями, более чем способна быть непредсказуемой без какого бы то ни было внешнего воздействия*
Т.В. Панченко «Генетические алгоритмы»

Слайд 7 Теорию Хаоса подтвердили:
Борис Белоусов (в процессе своих исследований, обнаружил

Теорию Хаоса подтвердили: Борис Белоусов (в процессе своих исследований, обнаружил кое-что очень

кое-что очень странное. Как-то у него на столе реактивы стали вести

себя необычно: они меняли цвет и спонтанно снова становились прозрачными. Они переходили туда и обратно от цветного к прозрачному, как будто ими управлял некий скрытый химический метроном. )
Лоренц Эдвард (он пытался найти математические уравнения, которые могли бы помочь в прогнозировании погоды. Когда Лоренц записал свои уравнения, описывающие движение воздушных потоков, они не дали предполагаемого результата)



Слайд 8 Гипотеза Мандельброта
 одна и та же форма повторяется во всё меньших и меньших

Гипотеза Мандельброта одна и та же форма повторяется во всё меньших и меньших масштабах  ветви деревьев.

масштабах
 ветви деревьев. Они разветвляются, повторяя этот простой процесс

во всё более и более меньших масштабах
Тот же принцип ветвления применим к строению лёгких и способу




Слайд 9 Математический принцип самоподобия Тьюринга-
одна и та же форма повторяется во всё

Математический принцип самоподобия Тьюринга-одна и та же форма повторяется во всё меньших и меньших масштабах. 

меньших и меньших масштабах. 


Слайд 10 Информацонно-биологическая концепция морфогенеза
• Морфоген
• Распределение сигнала

Информацонно-биологическая концепция морфогенеза• Морфоген • Распределение сигнала • Реакция • Начальные

Реакция
• Начальные данные

Морфоген - Вещества, оказывающие влияние

на морфогенез, называют морфогенами. Морфогены — функциональное, а не химическое понятие.


паттерн


Слайд 11 Морфоген
Условно понятие морфоген можно разделить на:
АКТИВАТОР
стимулирует образование второго

МорфогенУсловно понятие морфоген можно разделить на:АКТИВАТОРстимулирует образование второго вещества и себя

вещества и себя по принципу + обратной связи
ИНГИБИТОР
подавляет активность

активатора

Слайд 12 Баланс самоорганизации
Устойчивый паттерн --? спонтанное изменение---?новый паттерн

Повторение одних

Баланс самоорганизацииУстойчивый паттерн --? спонтанное изменение---?новый паттернПовторение одних и тех же

и тех же элементов с некоторыми вариациями у разных

видов организмов – рисунки на ракушках, пятна на шкуре гепарда, полосы на зебре

Слайд 13
Можно предположить, что в молекулярной биологии роль активаторов

Можно предположить, что в молекулярной биологии роль активаторов и ингибиторов играют

и ингибиторов играют гены.
То есть за развитие признака отвечает

баланс взаимодействия влияния генов (модель реакция-диффузия)

Слайд 14 Экспериментальное изучение
Эта гипотеза была проверена учеными из Канады*

Экспериментальное изучениеЭта гипотеза была проверена учеными из Канады* с помощью генно-инженерного

с помощью генно-инженерного эксперимента на мышах.
Это навело некоторых эмбриологов

на мысль, что формирование пальцев, возможно, основано не на «позиционной информации», задаваемой градиентом концентрации того или иного морфогена (как думали раньше), а на совсем другом принципе. Например, на тьюринговском реакционно-диффузионном механизме.
Было предроложено, что ген Shh/Gli3 отвечает за развитие пальцев. Но при отключении этого гена пальцы на кисти все равно развивались
Была изучена группа Hox-генов, малоизвестных в генетических экспериментах

 Shigeru Kondo, Takashi Miura. Reaction-Diffusion Model as a Framework for
Understanding Biological Pattern Formation // Science. 2010.


Слайд 15
Последовательно отключая эти гены была выведена закономерность изменения

Последовательно отключая эти гены была выведена закономерность изменения пальцев кисти у

пальцев кисти у мыши.
Gli3 отключен
Hox полный набор ?

развитие 7 пальцев
Gli3 отключен
Отключены гены Hox – «стремление пальцев к бесконечности» ? ПОДОБИЕ РЫБЬЕГО ПЛАВНИКА (Новый паттерн)


Слайд 16
Таким образом:
ПАТТЕРН 1
СЛУЧАЙНОЕ МИНИМАЛЬНОЕ ИЗМЕНЕНИЕ
ПАТТЕРН 2

Таким образом:ПАТТЕРН 1СЛУЧАЙНОЕ МИНИМАЛЬНОЕ ИЗМЕНЕНИЕПАТТЕРН 2

Слайд 17 Практическое применение
Фокомелия (тюленеобразные конечности) — отсутствие проксимальных и

Практическое применениеФокомелия (тюленеобразные конечности) — отсутствие проксимальных и (или) средних частей

(или) средних частей конечности и соответствующих суставов (плечевого, тазобедренного). 
Талидомидная

катастрофа.

Слайд 18 Применение в медицине
Ген, отвечающий за нормальную длину трубчатой

Применение в медицинеГен, отвечающий за нормальную длину трубчатой кости при развитии

кости при развитии конечности CiF8*
В литературе не было обнаружено

данных по изучению влияния на этот ген, поэтому генетические причины фокомелий остаются неизвестными.

 *Rushikesh Sheth, Luciano Marcon, M. Félix Bastida, Marisa Junco, Laura Quintana, Randall Dahn, Marie Kmita, James Sharpe, Maria A. Ros. HoxGenes Regulate Digit Patterning by Controlling the Wavelength of a Turing-Type Mechanism // Science. 2012


Слайд 19 Модель эксперимента
Проведение генно-инженерного эксперимента на животных в 3

Модель экспериментаПроведение генно-инженерного эксперимента на животных в 3 этапа:Отключение гена CiF8

этапа:
Отключение гена CiF8 по молекулярной технологии (разрушение ДНК при

помощи фермента с нуклеазой) с дальнейшим наблюдением развития конечности
Поиск генов «активатор – ингибитор» для определения «узора паттерна», то есть изменение в паттерне 1 (нормальная конечность) в паттерн 2 («ласты тюленя»)
Отключение генов, возвращение баланса в систему



Слайд 20 Применение в медицине
При успешном обнаружении этих 2групп генов

Применение в медицинеПри успешном обнаружении этих 2групп генов (активатор – ингибитор)

(активатор – ингибитор) и построении этой модели реакция –

диффузия станет возможно:
- Выключать ген активатор или ингибитор при нарушенном балансе «узора паттерна» (как следствие – предупреждения развития анатомической аномалии)

Слайд 21 Что для этого необходимо:

Что для этого необходимо:

Слайд 22 «Может ли взмах крыльев бабочки в Бразилии вызвать торнадо в Техасе?»
Эдвард

«Может ли взмах крыльев бабочки в Бразилии вызвать торнадо в Техасе?»Эдвард Лоренц «эффект бабочки»

Лоренц
«эффект бабочки» вызывает и аллюзию к рассказу 1952 года Р. Брэдбери «И грянул

гром», где гибель бабочки в далёком прошлом изменяет мир очень далекого будущего

  • Имя файла: osnovnye-aspekty-primeneniya-informatsionno-matematicheskih-mehanizmov-alana-tyuringa-v-molekulyarnoy-biologii.pptx
  • Количество просмотров: 115
  • Количество скачиваний: 0