- Главная
- Разное
- Бизнес и предпринимательство
- Образование
- Развлечения
- Государство
- Спорт
- Графика
- Культурология
- Еда и кулинария
- Лингвистика
- Религиоведение
- Черчение
- Физкультура
- ИЗО
- Психология
- Социология
- Английский язык
- Астрономия
- Алгебра
- Биология
- География
- Геометрия
- Детские презентации
- Информатика
- История
- Литература
- Маркетинг
- Математика
- Медицина
- Менеджмент
- Музыка
- МХК
- Немецкий язык
- ОБЖ
- Обществознание
- Окружающий мир
- Педагогика
- Русский язык
- Технология
- Физика
- Философия
- Химия
- Шаблоны, картинки для презентаций
- Экология
- Экономика
- Юриспруденция
Что такое findslide.org?
FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.
Обратная связь
Email: Нажмите что бы посмотреть
Презентация на тему Секвенирование
Содержание
- 2. План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
- 3. СЕКВЕНИРОВАНИЕСеквенирование — это определение нуклеотидной последовательности ДНК.
- 4. Для секвенирования ДНК в настоящее время используют
- 5. СЕКВЕНИРОВАНИЕ
- 6. СЕКВЕНИРОВАНИЕ ПО МЕТОДУ Сенгера
- 7. СЕКВЕНИРОВАНИЕ
- 8. СЕКВЕНИРОВАНИЕ
- 9. Если у вас 50 000 или 1
- 10. План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
- 11. Технология чипов
- 12. Технология чипов
- 13. Технология чиповMassively Parallel Signature Sequencing (MPSS)Polony sequencing454
- 14. Секвенирование Illumina: принцип метода1. ДНК фрагментируют и
- 15. Секвенирование Illumina - принцип метода7. Через ячейку
- 16. Illumina (Solexa) sequencing
- 17. Illumina (Solexa) sequencing1. Обнаружены точковые мутации при
- 18. Высокопроизводительное пиросеквенирование (454)Самая первая из технологий NGS
- 19. Секвенирование единичных молекул. Pacific Biosciences
- 20. Стоимость полногеномного секвенирования.
- 21. План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
- 22. Геном — совокупность наследственного материала, заключенного в клетке
- 23. Иследования ДНК особенно интенсивно пошли
- 24. Рестриктазы – бактериальные ферменты, расщепляющие
- 25. Начали возникать проекты по секвенированию (установление
- 26. 1980—1990 годы:постепенно, в молекулярной биологии выделился
- 27. В 1988 г. на
- 28. 23 пары хромосом у человека, в сумме
- 29. Проект «геном человека»выявлено не менее 1.5 миллиона мутаций, покоторым геномы людей отличаются друг от друга
- 30. Проект «геном человека»
- 31. Что дала геномика? oгромный объем информации по
- 32. План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
- 33. ПЕРВЫЕ ЛЮДИ С ИНДИВИДУАЛЬНЫМИ ПРОЧИТАННЫМИ ГЕНОМАМИ
- 34. ЛюдейЖивотныхРастенийБактерийГеномные базы данных
- 35. Наша геномная эра является свидетелем взрыва
- 36. автоматическая расшифровка нуклеотидных последовательностей -> ИНФОРМАЦИОННЫЙ ВЗРЫВ
- 37. План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
- 38. Одним из механизмов генетического разнообразия является изменение
- 39. Для SNPs существует большое количество баз данныхdbSNPSNPediaGWAS
- 40. SNP могут быть причиной наследственных заболеваний:Некоторые заболевания:
- 41. SNP используют как маркеры наследственных заболеваний:Некоторые заболевания:
- 43. http://www.ebi.ac.uk/2can/bioinformatics/bioinf_realworld_1.htmlМолекулярная медицина:1. Поиск мишеней для конструирования лекарственныхмолекул2. Персонализированная медицина3. Профилактическая медицина4. Генная терапия
- 44. Молекулярная медицина1. Персонализированная медицинаhttp://www.ornl.gov/hgmis/medicine/pharma.html2. Профилактическая медицинаhttp://www.ornl.gov/hgmis/medicine/genetest.html3. Генная терапияhttp://www.ornl.gov/hgmis/publicat/hgn/v10n1/15wilson.htmlhttp://www.fda.gov/fdac/features/2000/gene.htmlhttp://www.wiley.co.uk/genetherapy/clinical/http://cis.nci.nih.gov/fact/7_18.htmhttp://www.ornl.gov/hgmis/medicine/tnty.htmlhttp://www.faseb.org/opar/newsletter/jun98/junx5.html
- 45. Археогенетика анализ ДНК, полученной из археологических останков (древней
- 46. Переселение народов(теории миграции)
- 47. Анализ ДНК азиатских народовКаждый 12 монголец ♂–
- 48. Прородители людей (Адам и Ева)Анализ Y-хромосомАнализ ДНК митохондрий
- 50. Скачать презентацию
- 51. Похожие презентации
План:Принципы секвенированияСеквенаторы третьего покаленияГеном, геномикаСовременное положение секвенированияБазы данных секвенирования и их применение
Слайд 2
План:
Принципы секвенирования
Секвенаторы третьего покаления
Геном, геномика
Современное положение секвенирования
Базы данных
секвенирования и их применение
Слайд 4 Для секвенирования ДНК в настоящее время используют дидезоксинуклеотидный
метод, или метод ≪обрыва цепи≫
Метод разработан Ф. Сенгером в
1977 году. В 1980 году американцам Ф.Сенгеру и У.Гилберту была присуждена половина Нобелевской премии ≪за вклад в определение последовательности оснований в нуклеиновых кислотах≫.
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
Слайд 9 Если у вас 50 000 или 1 000
000/ 1 000 000 000 образцов ДНК?
МОДИФИКАЦИИ МЕТОДА СЕКВЕНИРОВАНИЯ
?????Например: ищите полиморфизные мутации при раке легкого
Слайд 10
План:
Принципы секвенирования
Секвенаторы третьего покаления
Геном, геномика
Современное положение секвенирования
Базы данных
секвенирования и их применение
Слайд 13
Технология чипов
Massively Parallel Signature Sequencing (MPSS)
Polony sequencing
454 pyrosequencing
Illumina
(Solexa) sequencing
SOLiD sequencing
Ion semiconductor sequencing
DNA nanoball sequencing
Heliscope single molecule
sequencingSingle molecule real time (SMRT) sequencing
Nanopore DNA sequencing
Sequencing by hybridization
Sequencing with mass spectrometry
Microfluidic Sanger s
equencing
Microscopy-based techniques
RNAP sequencing
In vitro virus high-throughput sequencing
Слайд 14
Секвенирование Illumina: принцип метода
1. ДНК фрагментируют и присоединяют
к фрагментам адаптеры
2. ДНК пропускают через каналы ячейки, покрытые
праймерами, комплементарными концам адаптеров3. Через ячейку пропускают реагенты для достраивания второй цепи ДНК
4. Двуцепочечные фрагменты денатурируют
Стадии 3-4 повторяются 30-35 раз
6. Каждый фрагмент оказывается окружен группой идентичных молекул («кластеры»).
Слайд 15
Секвенирование Illumina - принцип метода
7. Через ячейку пропускают
реагенты (флуоресцентно меченые терминированные dNTP и полимеразу)
8. На ячейку
светят лазером и проводят съемку.9. Через ячейку пропускают реагенты, отщепляющие флуорофор и терминатор
Слайд 17
Illumina (Solexa) sequencing
1. Обнаружены точковые мутации при раке
легкого (в сравнении со здоровыми)
Примеры результатов использования метода:
2.
Обнаружено свыше 50 000 новых полиморфизных мутаций 3. Просеквенировано 615 образцов ДНК больных неврологических заболеваний
4. Просеквенировано ДНК 50 случаев детского рака……….
Слайд 21
План:
Принципы секвенирования
Секвенаторы третьего покаления
Геном, геномика
Современное положение секвенирования
Базы данных
секвенирования и их применение
Слайд 22
Геном — совокупность наследственного материала, заключенного в клетке организма.
Термин «геном» был предложен немецким ботаником Гансом Винклером в
1920 году (Hans Karl Albert Winkler, 1877 —1945). Геном, геномика
Слайд 23
Иследования ДНК особенно интенсивно
пошли со
времени установления
принципов её построения.
Появилось много различных
методических подходов: специфическая фрагментация (рестриктазы), электрофорез и идентификация фрагментов, применение радиоактивных и флюоресцентных меток, получение большого количества копий (полимеразы).
Слайд 24
Рестриктазы – бактериальные
ферменты, расщепляющие
чужеродные
ДНК в определённых
последовательностях нуклеотидов.
Сочетание всё совершенствующихся методов исследования
с компьютерной обработкой данных значительно снижало временные и финансовые затраты на расшифровку геномов различных объектов:
Слайд 25
Начали возникать проекты по
секвенированию (установление
последовательности
) геномов отдельных видов живых организмов.
Первым,
в 1977 году, был полностью секвенирован геном
бактериофага Φ-X174 (5 368 нп).
Затем последовали и другие
объекты…
Слайд 26 1980—1990 годы:постепенно, в молекулярной биологии выделился раздел,
изучающий
геном и гены = геномика (установление структуры и выяснение
механизма функционирования генома в живых системах)К этому времени были изучены фрагменты ДНК человека, накопилось много сведений о наследственных заболеваниях в мировом сознании (прежде всего в медицинских кругах) зрела мысль о необходимости скорейшего исследования генома человека.
Слайд 27 В 1988 г. на базе
Национального Института
Здравоохранения США стартовал проект
программы «Геном человека».
Затем он стал международным, к которому
присоединились ведущие лаборатории многих
стран, главным образом:
Великобритании Франции
Германии Японии
России
В 2003 г. проект был успешно завершён.
Слайд 28 23 пары хромосом у человека, в сумме 46
хромосом
2 метра ДНК
3 миллиарда нуклеотидов
Приблизительно 30 000 генов кодирующих
белкиГеном человека
Слайд 29
Проект «геном человека»
выявлено не менее 1.5 миллиона мутаций,
по
которым геномы людей отличаются друг от друга
Слайд 31
Что дала геномика?
oгромный объем информации по первичным
структурам
ДНК.
понимание молекулярных механизмов заболеваний;
новые подходы в создании
лекарств, новыедиагностические тесты, генная терапия;
трансгенные животные и растения.
недостаток геномики –
Мы знаем весь геном, но не знаем, что реально
экспрессируется и что реально работает в клетке
+
+
+
+
+
Слайд 32
План:
Принципы секвенирования
Секвенаторы третьего покаления
Геном, геномика
Современное положение секвенирования
Базы данных
секвенирования и их применение
Слайд 35 Наша геномная эра является свидетелем взрыва объема
биологической информации доступной из-за гигантским достижениям в области молекулярной
биологии и геномики
Слайд 37
План:
Принципы секвенирования
Секвенаторы третьего покаления
Геном, геномика
Современное положение секвенирования
Базы данных
секвенирования и их применение
Слайд 38 Одним из механизмов генетического разнообразия является изменение «буквы»
генетического кода (СНП - сингулярный нуклеотидный полиморфизм; SNP -
single nucleotide polymorphism).Полагают, что у человека СНП встречается с частотой 0,1%, т.е. конкретный человек отличается от других одним нуклеотидом на каждую тысячу нуклеотидов.
Слайд 39
Для SNPs существует большое количество баз данных
dbSNP
SNPedia
GWAS Central
International
HapMap Project
MirSNP
Большинство генов в каждом организме представлено двумя аллелями,
один из которых унаследован от отца, а другой - от матери. Если оба аллеля идентичны, то организм считается гомозиготным, если разные - гетерозиготным .
Слайд 43
http://www.ebi.ac.uk/2can/bioinformatics/bioinf_realworld_1.html
Молекулярная медицина:
1. Поиск мишеней для конструирования лекарственных
молекул
2. Персонализированная
медицина
3. Профилактическая медицина
4. Генная терапия
Слайд 44
Молекулярная медицина
1. Персонализированная медицина
http://www.ornl.gov/hgmis/medicine/pharma.html
2. Профилактическая медицина
http://www.ornl.gov/hgmis/medicine/genetest.html
3. Генная терапия
http://www.ornl.gov/hgmis/publicat/hgn/v10n1/15wilson.html
http://www.fda.gov/fdac/features/2000/gene.html
http://www.wiley.co.uk/genetherapy/clinical/
http://cis.nci.nih.gov/fact/7_18.htm
http://www.ornl.gov/hgmis/medicine/tnty.html
http://www.faseb.org/opar/newsletter/jun98/junx5.html
Слайд 45
Археогенетика
анализ ДНК, полученной из археологических останков (древней ДНК, англ. aDNA);
анализ ДНК современных популяций (людей, домашних растений и животных)
с целью изучения человеческого прошлого и генетического наследия взаимодействия человека с биосферой;Период полураспада ДНК – 521 год
ДНК полностью теряет читабельность через 1,5 миллиона лет (в вечной мерзлоте и пещерах – дольше) (оставшиеся короткие фрагменты нечитабельны)
Кости полностью разрушаются через 6,8 миллиона лет
ДНК неардентальца просеквенирована на 60%
Слайд 47
Анализ ДНК азиатских народов
Каждый 12 монголец ♂– потомок
Чингисхана
Анализ Y-хромосом
(казахи ♂ – каждый сотый; калмыки, буряты...)
Китайские ученые просеквенировали ДНК Чингисхана в 2011 году
(Официально: 3 жены = 8 сыновей и 5 дочерей)
