Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.

Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Виртуальный скрининг

Содержание

Занятие 4Виртуальный скрининг
Занятие 4Виртуальный скрининг Высокопроизводительный скрининг—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений Недостатки:Достоинства:СтоимостьВ некоторых случаях невозможно разработать подходящую Высокопроизводительный VS виртуальный скринингВиртуальный скрининг—оценка соединений вычислительными методами Виртуальный скрининг Виртуальный скринингПреимущества:СкоростьНизкая себестоимостьШирокие возможностиНедостатки:Достоверность Виртуальный скрининг Виртуальный скрининг Генерация библиотек ФильтрацияПодструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)Физико-химические свойства PAINS Pan Assay Interference CompoundsBaell & Walters, Nature, 2014, 513, 481-483 Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)Применяется:Поиск по сходству структур (similarity search)Поиск по Успехи LBVSДля испытанийДействительно испытанных Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)—докинг во всём его многообразии Дизайн de novoИдея состоит в том, чтобы собрать лиганд прямо в сайте «с нуля». SAR и QSARSAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активностьQSAR – Quantitave Structure Activity SARIC50 = 100nMIC50 = 10nMIC50 = 20nMIC50 = 1000nMIC50 < 100nMвероятно:IC50 > 100nM SAR. Примеры.Что и как можно менять?—зависит от конкретной задачиБиоизостерические заменыИзменение числа метиленовых SAR и QSARAntimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5): 2233–2244.IC50, nMhttps://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.pngPlasmodium falciparum QSAR
Слайды презентации

Слайд 2 Занятие 4
Виртуальный скрининг

Занятие 4Виртуальный скрининг

Слайд 3 Высокопроизводительный скрининг
—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений
Недостатки:


Достоинства:
Стоимость
В некоторых

Высокопроизводительный скрининг—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений Недостатки:Достоинства:СтоимостьВ некоторых случаях невозможно разработать

случаях невозможно разработать подходящую методику

Надёжность
Высокая эффективность при правильном использовании

Слайд 4

Слайд 5 Высокопроизводительный VS виртуальный скрининг
Виртуальный скрининг
—оценка соединений вычислительными методами

Высокопроизводительный VS виртуальный скринингВиртуальный скрининг—оценка соединений вычислительными методами

Слайд 6 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 7 Виртуальный скрининг
Преимущества:

Скорость
Низкая себестоимость
Широкие возможности

Недостатки:

Достоверность

Виртуальный скринингПреимущества:СкоростьНизкая себестоимостьШирокие возможностиНедостатки:Достоверность

Слайд 8 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 9 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 10 Генерация библиотек

Генерация библиотек

Слайд 11 Фильтрация
Подструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)
Физико-химические свойства

ФильтрацияПодструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)Физико-химические свойства

Слайд 12 PAINS Pan Assay Interference Compounds
Baell & Walters, Nature,

PAINS Pan Assay Interference CompoundsBaell & Walters, Nature, 2014, 513, 481-483

2014, 513, 481-483

Слайд 13 Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)
Применяется:

Поиск по сходству

Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)Применяется:Поиск по сходству структур (similarity search)Поиск

структур (similarity search)
Поиск по сходству фармакофора
На основе значений дескрипторов

Слайд 14 Успехи LBVS
Для испытаний
Действительно испытанных

Успехи LBVSДля испытанийДействительно испытанных

Слайд 15 Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)
—докинг во всём

Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)—докинг во всём его многообразии

его многообразии

Слайд 16 Дизайн de novo
Идея состоит в том, чтобы собрать

Дизайн de novoИдея состоит в том, чтобы собрать лиганд прямо в сайте «с нуля».

лиганд прямо в сайте «с нуля».

Слайд 17 SAR и QSAR
SAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активность

QSAR

SAR и QSARSAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активностьQSAR – Quantitave Structure

– Quantitave Structure Activity Relationships. Поиск количественной зависимости структура-активность

Слайд 18 SAR
IC50 = 100nM
IC50 = 10nM
IC50 = 20nM
IC50 =

SARIC50 = 100nMIC50 = 10nMIC50 = 20nMIC50 = 1000nMIC50 < 100nMвероятно:IC50 > 100nM

1000nM
IC50 < 100nM
вероятно:
IC50 > 100nM

Слайд 19 SAR. Примеры.
Что и как можно менять?
—зависит от конкретной

SAR. Примеры.Что и как можно менять?—зависит от конкретной задачиБиоизостерические заменыИзменение числа

задачи
Биоизостерические замены
Изменение числа метиленовых групп
Изменение степени ненасыщенности
Введение или удаление

циклических систем

Слайд 20 SAR и QSAR
Antimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5):

SAR и QSARAntimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5): 2233–2244.IC50, nMhttps://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.pngPlasmodium falciparum

2233–2244.
IC50, nM
https://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.png
Plasmodium falciparum

  • Имя файла: virtualnyy-skrining.pptx
  • Количество просмотров: 135
  • Количество скачиваний: 0
- Предыдущая Значение корней в жизни растений
Следующая - Максим Рыльский

Похожие презентации

шоколад шоколад 154
Перитонит. Этиология перитонита Перитонит. Этиология перитонита 148
Балалардағы пародонт ауруларының жалпы емі Балалардағы пародонт ауруларының жалпы емі 182
Воспаление. Этиология. Медиаторы. Виды. Острое воспаление Воспаление. Этиология. Медиаторы. Виды. Острое воспаление 149
Легочные синдромы. Хроническая обструктивная болезнь легких. Бронхиальная астма Легочные синдромы. Хроническая обструктивная болезнь легких. Бронхиальная астма 141
Классификация хирургических инструментов Классификация хирургических инструментов 124
Тесты по медицине Тесты по медицине 156
ВМА - КТ в диагностике заболеваний и новообразований полых органов желудочно-кишечного тракта ВМА - КТ в диагностике заболеваний и новообразований полых органов желудочно-кишечного тракта 154
Азықтық әсерлі қосындылар Азықтық әсерлі қосындылар 100
перинатальная передача ВИЧ инфекций перинатальная передача ВИЧ инфекций 137
Симптомы и синдромы при хронических гепатитах и циррозах печени. Печеночная кома, диагностика и неотложная терапия Симптомы и синдромы при хронических гепатитах и циррозах печени. Печеночная кома, диагностика и неотложная терапия 121
Профессиональные заболевания кожи Профессиональные заболевания кожи 141
Терминальное состояние Терминальное состояние 147
Лабораторная информационная система как инструмент развития современной лаборатории Лабораторная информационная система как инструмент развития современной лаборатории 166
Индивидуальная профилактика рецидивов хронического катарального гингивита у детей Индивидуальная профилактика рецидивов хронического катарального гингивита у детей 122
Наиболее частые жалобы при повышении АД Наиболее частые жалобы при повышении АД 129
ЭКСТРАПИРАМИДНАЯ СИСТЕМА ЭКСТРАПИРАМИДНАЯ СИСТЕМА 164
КЛИНИЧЕСКОЕ МАТЕРИАЛОВЕДЕНИЕ. СПЛАВЫ МЕТАЛЛОВ ДЛЯ ЗУБНЫХ ПРОТЕЗОВ, ИХ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И ТРЕБОВАНИЯ К НИМ, МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ И ТЕХНИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА. КЛИНИЧЕСКИЕ УСЛОВИЯ, ВЛИЯЮЩИ КЛИНИЧЕСКОЕ МАТЕРИАЛОВЕДЕНИЕ. СПЛАВЫ МЕТАЛЛОВ ДЛЯ ЗУБНЫХ ПРОТЕЗОВ, ИХ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И ТРЕБОВАНИЯ К НИМ, МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ И ТЕХНИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА. КЛИНИЧЕСКИЕ УСЛОВИЯ, ВЛИЯЮЩИ 157
Новые технологии в лечении повреждений печени Новые технологии в лечении повреждений печени 115
Жизнь с сердечной недостаточностью Жизнь с сердечной недостаточностью 134
Остеоартроз Остеоартроз 125
Я выбираю жизнь Я выбираю жизнь 128
Гипертоническая болезнь Гипертоническая болезнь 159
Острый дакриоцистит Острый дакриоцистит 137
Фармакодинамика лекарственных средств Фармакодинамика лекарственных средств 133
КТ диагностика травмы органов брюшной полости КТ диагностика травмы органов брюшной полости 133
Нормальная микрофлора человека. Нормальная микрофлора человека. 137
Производные пиразола Производные пиразола 141
Cerebral-vascular diseases Cerebral-vascular diseases 171
Индивидуальные средства защиты кожи и медицинские средства защиты Индивидуальные средства защиты кожи и медицинские средства защиты 146